Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,19■■■■■ 4,66
Samd11Q1RNF8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,13■■■■■ 4,17
Samd11Q1RNF8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Samd11Q1RNF8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,59■■■■□ 3,77
Samd11Q1RNF8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,08■■■■□ 3,69
Samd11Q1RNF8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Samd11Q1RNF8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Samd11Q1RNF8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Samd11Q1RNF8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,06■■■■□ 3,52
Samd11Q1RNF8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,91■■■■□ 3,5
Samd11Q1RNF8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
Samd11Q1RNF8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,17■■■■□ 3,38
Samd11Q1RNF8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Samd11Q1RNF8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Samd11Q1RNF8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,73■■■■□ 3,31
Samd11Q1RNF8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Samd11Q1RNF8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Samd11Q1RNF8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Samd11Q1RNF8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Samd11Q1RNF8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Samd11Q1RNF8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Samd11Q1RNF8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,02■■■■□ 3,2
Samd11Q1RNF8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Samd11Q1RNF8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Samd11Q1RNF8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Samd11Q1RNF8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Samd11Q1RNF8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Samd11Q1RNF8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Samd11Q1RNF8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Samd11Q1RNF8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Samd11Q1RNF8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Samd11Q1RNF8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Samd11Q1RNF8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Samd11Q1RNF8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,7■■■□□ 2,99
Samd11Q1RNF8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Samd11Q1RNF8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Samd11Q1RNF8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,57■■■□□ 2,96
Samd11Q1RNF8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Samd11Q1RNF8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Samd11Q1RNF8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Samd11Q1RNF8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,39■■■□□ 2,94
Samd11Q1RNF8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Samd11Q1RNF8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Samd11Q1RNF8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Samd11Q1RNF8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,24■■■□□ 2,91
Samd11Q1RNF8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,24■■■□□ 2,91
Samd11Q1RNF8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Samd11Q1RNF8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Samd11Q1RNF8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Samd11Q1RNF8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Samd11Q1RNF8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Samd11Q1RNF8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
Samd11Q1RNF8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Samd11Q1RNF8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Samd11Q1RNF8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Samd11Q1RNF8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Samd11Q1RNF8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Samd11Q1RNF8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Samd11Q1RNF8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Samd11Q1RNF8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Samd11Q1RNF8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Samd11Q1RNF8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Samd11Q1RNF8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Samd11Q1RNF8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Samd11Q1RNF8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Samd11Q1RNF8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Samd11Q1RNF8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Samd11Q1RNF8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Samd11Q1RNF8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Samd11Q1RNF8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,16■■■□□ 2,74
Samd11Q1RNF8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Samd11Q1RNF8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Samd11Q1RNF8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Samd11Q1RNF8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Samd11Q1RNF8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Samd11Q1RNF8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32■■■□□ 2,71
Samd11Q1RNF8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Samd11Q1RNF8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,91■■■□□ 2,7
Samd11Q1RNF8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Samd11Q1RNF8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Samd11Q1RNF8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Samd11Q1RNF8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Samd11Q1RNF8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Samd11Q1RNF8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,71■■■□□ 2,67
Samd11Q1RNF8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Samd11Q1RNF8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Samd11Q1RNF8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Samd11Q1RNF8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Samd11Q1RNF8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Samd11Q1RNF8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Samd11Q1RNF8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Samd11Q1RNF8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Samd11Q1RNF8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Samd11Q1RNF8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Samd11Q1RNF8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Samd11Q1RNF8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,45■■■□□ 2,63
Samd11Q1RNF8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Samd11Q1RNF8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31,37■■■□□ 2,61
Samd11Q1RNF8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Samd11Q1RNF8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
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