Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Tac1P41539 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,07■■■□□ 2,88
Tac1P41539 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,84
Tac1P41539 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Tac1P41539 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Tac1P41539 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Tac1P41539 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Tac1P41539 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Tac1P41539 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Tac1P41539 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Tac1P41539 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Tac1P41539 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Tac1P41539 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Tac1P41539 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Tac1P41539 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Tac1P41539 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Tac1P41539 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Tac1P41539 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Tac1P41539 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Tac1P41539 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Tac1P41539 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Tac1P41539 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Tac1P41539 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Tac1P41539 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Tac1P41539 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Tac1P41539 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Tac1P41539 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Tac1P41539 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Tac1P41539 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Tac1P41539 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Tac1P41539 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Tac1P41539 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Tac1P41539 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Tac1P41539 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Tac1P41539 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Tac1P41539 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Tac1P41539 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tac1P41539 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Tac1P41539 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tac1P41539 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tac1P41539 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Tac1P41539 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tac1P41539 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tac1P41539 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Tac1P41539 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tac1P41539 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tac1P41539 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Tac1P41539 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tac1P41539 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tac1P41539 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tac1P41539 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tac1P41539 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Tac1P41539 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tac1P41539 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tac1P41539 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tac1P41539 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tac1P41539 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Tac1P41539 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Tac1P41539 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Tac1P41539 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Tac1P41539 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Tac1P41539 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Tac1P41539 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Tac1P41539 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,79■■■□□ 2,04
Tac1P41539 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Tac1P41539 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Tac1P41539 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Tac1P41539 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Tac1P41539 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Tac1P41539 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Tac1P41539 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Tac1P41539 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Tac1P41539 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Tac1P41539 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Tac1P41539 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Tac1P41539 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Tac1P41539 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Tac1P41539 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Tac1P41539 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Tac1P41539 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Tac1P41539 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tac1P41539 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tac1P41539 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Tac1P41539 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tac1P41539 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tac1P41539 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tac1P41539 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tac1P41539 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Tac1P41539 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tac1P41539 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Tac1P41539 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Tac1P41539 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Tac1P41539 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Tac1P41539 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Tac1P41539 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Tac1P41539 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Tac1P41539 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Tac1P41539 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Tac1P41539 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Tac1P41539 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms