Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,47■■■■□ 3,27
Aph1bQ8C7N7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Aph1bQ8C7N7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Aph1bQ8C7N7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Aph1bQ8C7N7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Aph1bQ8C7N7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,36■■■□□ 2,77
Aph1bQ8C7N7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Aph1bQ8C7N7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Aph1bQ8C7N7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,71■■■□□ 2,67
Aph1bQ8C7N7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Aph1bQ8C7N7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Aph1bQ8C7N7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Aph1bQ8C7N7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,21■■■□□ 2,59
Aph1bQ8C7N7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Aph1bQ8C7N7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,13■■■□□ 2,57
Aph1bQ8C7N7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Aph1bQ8C7N7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Aph1bQ8C7N7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Aph1bQ8C7N7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,49
Aph1bQ8C7N7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
Aph1bQ8C7N7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Aph1bQ8C7N7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Aph1bQ8C7N7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Aph1bQ8C7N7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,45
Aph1bQ8C7N7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Aph1bQ8C7N7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Aph1bQ8C7N7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Aph1bQ8C7N7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Aph1bQ8C7N7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Aph1bQ8C7N7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Aph1bQ8C7N7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Aph1bQ8C7N7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Aph1bQ8C7N7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Aph1bQ8C7N7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Aph1bQ8C7N7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Aph1bQ8C7N7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Aph1bQ8C7N7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Aph1bQ8C7N7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Aph1bQ8C7N7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Aph1bQ8C7N7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Aph1bQ8C7N7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Aph1bQ8C7N7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Aph1bQ8C7N7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Aph1bQ8C7N7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Aph1bQ8C7N7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Aph1bQ8C7N7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Aph1bQ8C7N7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Aph1bQ8C7N7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Aph1bQ8C7N7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Aph1bQ8C7N7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Aph1bQ8C7N7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Aph1bQ8C7N7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Aph1bQ8C7N7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Aph1bQ8C7N7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Aph1bQ8C7N7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Aph1bQ8C7N7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Aph1bQ8C7N7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Aph1bQ8C7N7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Aph1bQ8C7N7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
Aph1bQ8C7N7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Aph1bQ8C7N7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Aph1bQ8C7N7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Aph1bQ8C7N7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Aph1bQ8C7N7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Aph1bQ8C7N7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Aph1bQ8C7N7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Aph1bQ8C7N7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Aph1bQ8C7N7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Aph1bQ8C7N7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Aph1bQ8C7N7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Aph1bQ8C7N7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Aph1bQ8C7N7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Aph1bQ8C7N7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Aph1bQ8C7N7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Aph1bQ8C7N7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Aph1bQ8C7N7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Aph1bQ8C7N7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Aph1bQ8C7N7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Aph1bQ8C7N7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Aph1bQ8C7N7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Aph1bQ8C7N7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Aph1bQ8C7N7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Aph1bQ8C7N7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Aph1bQ8C7N7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Aph1bQ8C7N7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Aph1bQ8C7N7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Aph1bQ8C7N7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Aph1bQ8C7N7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Aph1bQ8C7N7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Aph1bQ8C7N7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Aph1bQ8C7N7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Aph1bQ8C7N7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Aph1bQ8C7N7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Aph1bQ8C7N7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Aph1bQ8C7N7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Aph1bQ8C7N7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Aph1bQ8C7N7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Aph1bQ8C7N7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Aph1bQ8C7N7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Aph1bQ8C7N7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
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