Protein–RNA interactions for Protein: P56567

Csta, Cystatin-A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CstaP56567 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
CstaP56567 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CstaP56567 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CstaP56567 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CstaP56567 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CstaP56567 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CstaP56567 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CstaP56567 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CstaP56567 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CstaP56567 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CstaP56567 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CstaP56567 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CstaP56567 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CstaP56567 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CstaP56567 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CstaP56567 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CstaP56567 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CstaP56567 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CstaP56567 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CstaP56567 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CstaP56567 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CstaP56567 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CstaP56567 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CstaP56567 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CstaP56567 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CstaP56567 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CstaP56567 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CstaP56567 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CstaP56567 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CstaP56567 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CstaP56567 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CstaP56567 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CstaP56567 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CstaP56567 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CstaP56567 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CstaP56567 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CstaP56567 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CstaP56567 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CstaP56567 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CstaP56567 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CstaP56567 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CstaP56567 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CstaP56567 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CstaP56567 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CstaP56567 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CstaP56567 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CstaP56567 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CstaP56567 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CstaP56567 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CstaP56567 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CstaP56567 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CstaP56567 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CstaP56567 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CstaP56567 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CstaP56567 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CstaP56567 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CstaP56567 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CstaP56567 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CstaP56567 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CstaP56567 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CstaP56567 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CstaP56567 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CstaP56567 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CstaP56567 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CstaP56567 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CstaP56567 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CstaP56567 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CstaP56567 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CstaP56567 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CstaP56567 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CstaP56567 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CstaP56567 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CstaP56567 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CstaP56567 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CstaP56567 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CstaP56567 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CstaP56567 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CstaP56567 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CstaP56567 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CstaP56567 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CstaP56567 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CstaP56567 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CstaP56567 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CstaP56567 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CstaP56567 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CstaP56567 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CstaP56567 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CstaP56567 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CstaP56567 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CstaP56567 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CstaP56567 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CstaP56567 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CstaP56567 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CstaP56567 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CstaP56567 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CstaP56567 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CstaP56567 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CstaP56567 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CstaP56567 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CstaP56567 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms