Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,9■■■■□ 3,18
Cul3Q9JLV5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Cul3Q9JLV5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Cul3Q9JLV5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Cul3Q9JLV5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Cul3Q9JLV5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Cul3Q9JLV5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,67■■■□□ 2,66
Cul3Q9JLV5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Cul3Q9JLV5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Cul3Q9JLV5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,02■■■□□ 2,56
Cul3Q9JLV5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Cul3Q9JLV5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Cul3Q9JLV5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Cul3Q9JLV5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Cul3Q9JLV5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Cul3Q9JLV5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Cul3Q9JLV5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Cul3Q9JLV5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Cul3Q9JLV5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Cul3Q9JLV5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Cul3Q9JLV5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Cul3Q9JLV5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Cul3Q9JLV5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cul3Q9JLV5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Cul3Q9JLV5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cul3Q9JLV5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cul3Q9JLV5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cul3Q9JLV5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cul3Q9JLV5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Cul3Q9JLV5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Cul3Q9JLV5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cul3Q9JLV5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cul3Q9JLV5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Cul3Q9JLV5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Cul3Q9JLV5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cul3Q9JLV5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cul3Q9JLV5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Cul3Q9JLV5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cul3Q9JLV5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cul3Q9JLV5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cul3Q9JLV5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Cul3Q9JLV5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Cul3Q9JLV5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Cul3Q9JLV5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Cul3Q9JLV5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Cul3Q9JLV5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Cul3Q9JLV5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Cul3Q9JLV5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Cul3Q9JLV5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cul3Q9JLV5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Cul3Q9JLV5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Cul3Q9JLV5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Cul3Q9JLV5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Cul3Q9JLV5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cul3Q9JLV5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Cul3Q9JLV5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Cul3Q9JLV5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cul3Q9JLV5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cul3Q9JLV5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cul3Q9JLV5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Cul3Q9JLV5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Cul3Q9JLV5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cul3Q9JLV5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Cul3Q9JLV5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Cul3Q9JLV5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Cul3Q9JLV5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Cul3Q9JLV5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Cul3Q9JLV5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Cul3Q9JLV5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Cul3Q9JLV5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Cul3Q9JLV5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Cul3Q9JLV5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Cul3Q9JLV5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Cul3Q9JLV5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Cul3Q9JLV5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,53■■■□□ 2
Cul3Q9JLV5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Cul3Q9JLV5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Cul3Q9JLV5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Cul3Q9JLV5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cul3Q9JLV5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Cul3Q9JLV5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Cul3Q9JLV5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Cul3Q9JLV5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Cul3Q9JLV5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Cul3Q9JLV5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Cul3Q9JLV5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,96
Cul3Q9JLV5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cul3Q9JLV5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Cul3Q9JLV5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Cul3Q9JLV5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cul3Q9JLV5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cul3Q9JLV5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cul3Q9JLV5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cul3Q9JLV5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Cul3Q9JLV5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Cul3Q9JLV5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cul3Q9JLV5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cul3Q9JLV5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Cul3Q9JLV5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cul3Q9JLV5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms