Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,86■■■■□ 3,01
GsdmcQ99NB5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
GsdmcQ99NB5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,91■■■□□ 2,7
GsdmcQ99NB5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
GsdmcQ99NB5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
GsdmcQ99NB5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
GsdmcQ99NB5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
GsdmcQ99NB5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
GsdmcQ99NB5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
GsdmcQ99NB5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
GsdmcQ99NB5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
GsdmcQ99NB5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
GsdmcQ99NB5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
GsdmcQ99NB5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
GsdmcQ99NB5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
GsdmcQ99NB5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
GsdmcQ99NB5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
GsdmcQ99NB5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
GsdmcQ99NB5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
GsdmcQ99NB5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
GsdmcQ99NB5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,28■■■□□ 2,28
GsdmcQ99NB5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
GsdmcQ99NB5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
GsdmcQ99NB5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
GsdmcQ99NB5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
GsdmcQ99NB5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
GsdmcQ99NB5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
GsdmcQ99NB5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
GsdmcQ99NB5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
GsdmcQ99NB5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
GsdmcQ99NB5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
GsdmcQ99NB5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
GsdmcQ99NB5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
GsdmcQ99NB5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
GsdmcQ99NB5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
GsdmcQ99NB5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
GsdmcQ99NB5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
GsdmcQ99NB5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
GsdmcQ99NB5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
GsdmcQ99NB5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
GsdmcQ99NB5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
GsdmcQ99NB5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
GsdmcQ99NB5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
GsdmcQ99NB5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
GsdmcQ99NB5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
GsdmcQ99NB5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
GsdmcQ99NB5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
GsdmcQ99NB5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
GsdmcQ99NB5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
GsdmcQ99NB5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
GsdmcQ99NB5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
GsdmcQ99NB5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
GsdmcQ99NB5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
GsdmcQ99NB5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
GsdmcQ99NB5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
GsdmcQ99NB5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
GsdmcQ99NB5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,7■■■□□ 2,02
GsdmcQ99NB5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,64■■■□□ 2,02
GsdmcQ99NB5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
GsdmcQ99NB5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,55■■■□□ 2
GsdmcQ99NB5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
GsdmcQ99NB5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,3■■□□□ 1,96
GsdmcQ99NB5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
GsdmcQ99NB5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
GsdmcQ99NB5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
GsdmcQ99NB5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
GsdmcQ99NB5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
GsdmcQ99NB5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
GsdmcQ99NB5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
GsdmcQ99NB5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
GsdmcQ99NB5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
GsdmcQ99NB5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
GsdmcQ99NB5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
GsdmcQ99NB5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
GsdmcQ99NB5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,92■■□□□ 1,9
GsdmcQ99NB5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
GsdmcQ99NB5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,89
GsdmcQ99NB5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
GsdmcQ99NB5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
GsdmcQ99NB5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
GsdmcQ99NB5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
GsdmcQ99NB5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
GsdmcQ99NB5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
GsdmcQ99NB5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
GsdmcQ99NB5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
GsdmcQ99NB5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
GsdmcQ99NB5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
GsdmcQ99NB5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
GsdmcQ99NB5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
GsdmcQ99NB5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
GsdmcQ99NB5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,59■■□□□ 1,85
GsdmcQ99NB5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
GsdmcQ99NB5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
GsdmcQ99NB5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
GsdmcQ99NB5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
GsdmcQ99NB5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
GsdmcQ99NB5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
GsdmcQ99NB5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
GsdmcQ99NB5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
GsdmcQ99NB5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms