Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
GsdmcQ99NB5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GsdmcQ99NB5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GsdmcQ99NB5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GsdmcQ99NB5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GsdmcQ99NB5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
GsdmcQ99NB5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GsdmcQ99NB5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GsdmcQ99NB5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GsdmcQ99NB5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
GsdmcQ99NB5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GsdmcQ99NB5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GsdmcQ99NB5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GsdmcQ99NB5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GsdmcQ99NB5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GsdmcQ99NB5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GsdmcQ99NB5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GsdmcQ99NB5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GsdmcQ99NB5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GsdmcQ99NB5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GsdmcQ99NB5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GsdmcQ99NB5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GsdmcQ99NB5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GsdmcQ99NB5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GsdmcQ99NB5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GsdmcQ99NB5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GsdmcQ99NB5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GsdmcQ99NB5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GsdmcQ99NB5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GsdmcQ99NB5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GsdmcQ99NB5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GsdmcQ99NB5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GsdmcQ99NB5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GsdmcQ99NB5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GsdmcQ99NB5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GsdmcQ99NB5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GsdmcQ99NB5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GsdmcQ99NB5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GsdmcQ99NB5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GsdmcQ99NB5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GsdmcQ99NB5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GsdmcQ99NB5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GsdmcQ99NB5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GsdmcQ99NB5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GsdmcQ99NB5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GsdmcQ99NB5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GsdmcQ99NB5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GsdmcQ99NB5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GsdmcQ99NB5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GsdmcQ99NB5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GsdmcQ99NB5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GsdmcQ99NB5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GsdmcQ99NB5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GsdmcQ99NB5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GsdmcQ99NB5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GsdmcQ99NB5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GsdmcQ99NB5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GsdmcQ99NB5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GsdmcQ99NB5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GsdmcQ99NB5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GsdmcQ99NB5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GsdmcQ99NB5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GsdmcQ99NB5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GsdmcQ99NB5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GsdmcQ99NB5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GsdmcQ99NB5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GsdmcQ99NB5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GsdmcQ99NB5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GsdmcQ99NB5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GsdmcQ99NB5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GsdmcQ99NB5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GsdmcQ99NB5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GsdmcQ99NB5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GsdmcQ99NB5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GsdmcQ99NB5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GsdmcQ99NB5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GsdmcQ99NB5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GsdmcQ99NB5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GsdmcQ99NB5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GsdmcQ99NB5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GsdmcQ99NB5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GsdmcQ99NB5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GsdmcQ99NB5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GsdmcQ99NB5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GsdmcQ99NB5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GsdmcQ99NB5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GsdmcQ99NB5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GsdmcQ99NB5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GsdmcQ99NB5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GsdmcQ99NB5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GsdmcQ99NB5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GsdmcQ99NB5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GsdmcQ99NB5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GsdmcQ99NB5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GsdmcQ99NB5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GsdmcQ99NB5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GsdmcQ99NB5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GsdmcQ99NB5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GsdmcQ99NB5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GsdmcQ99NB5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms