Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,54■■■■□ 3,92
Lysmd3Q99LE3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Lysmd3Q99LE3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Lysmd3Q99LE3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Lysmd3Q99LE3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,72■■■■□ 3,15
Lysmd3Q99LE3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,18■■■■□ 3,06
Lysmd3Q99LE3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Lysmd3Q99LE3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Lysmd3Q99LE3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Lysmd3Q99LE3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Lysmd3Q99LE3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Lysmd3Q99LE3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Lysmd3Q99LE3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,04■■■□□ 2,88
Lysmd3Q99LE3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Lysmd3Q99LE3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Lysmd3Q99LE3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,5■■■□□ 2,79
Lysmd3Q99LE3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Lysmd3Q99LE3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Lysmd3Q99LE3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Lysmd3Q99LE3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
Lysmd3Q99LE3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Lysmd3Q99LE3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2,71
Lysmd3Q99LE3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Lysmd3Q99LE3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Lysmd3Q99LE3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Lysmd3Q99LE3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,86■■■□□ 2,69
Lysmd3Q99LE3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,76■■■□□ 2,68
Lysmd3Q99LE3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Lysmd3Q99LE3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Lysmd3Q99LE3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Lysmd3Q99LE3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Lysmd3Q99LE3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Lysmd3Q99LE3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Lysmd3Q99LE3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Lysmd3Q99LE3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Lysmd3Q99LE3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Lysmd3Q99LE3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Lysmd3Q99LE3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Lysmd3Q99LE3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Lysmd3Q99LE3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Lysmd3Q99LE3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Lysmd3Q99LE3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Lysmd3Q99LE3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Lysmd3Q99LE3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Lysmd3Q99LE3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Lysmd3Q99LE3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Lysmd3Q99LE3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Lysmd3Q99LE3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Lysmd3Q99LE3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Lysmd3Q99LE3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,51■■■□□ 2,47
Lysmd3Q99LE3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,45■■■□□ 2,47
Lysmd3Q99LE3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Lysmd3Q99LE3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Lysmd3Q99LE3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Lysmd3Q99LE3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Lysmd3Q99LE3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Lysmd3Q99LE3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Lysmd3Q99LE3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Lysmd3Q99LE3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Lysmd3Q99LE3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Lysmd3Q99LE3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Lysmd3Q99LE3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Lysmd3Q99LE3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Lysmd3Q99LE3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Lysmd3Q99LE3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Lysmd3Q99LE3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Lysmd3Q99LE3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Lysmd3Q99LE3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Lysmd3Q99LE3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Lysmd3Q99LE3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Lysmd3Q99LE3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Lysmd3Q99LE3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Lysmd3Q99LE3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Lysmd3Q99LE3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Lysmd3Q99LE3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Lysmd3Q99LE3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Lysmd3Q99LE3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Lysmd3Q99LE3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Lysmd3Q99LE3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
Lysmd3Q99LE3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Lysmd3Q99LE3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Lysmd3Q99LE3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Lysmd3Q99LE3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Lysmd3Q99LE3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Lysmd3Q99LE3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Lysmd3Q99LE3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Lysmd3Q99LE3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Lysmd3Q99LE3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Lysmd3Q99LE3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Lysmd3Q99LE3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Lysmd3Q99LE3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Lysmd3Q99LE3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Lysmd3Q99LE3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Lysmd3Q99LE3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Lysmd3Q99LE3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Lysmd3Q99LE3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Lysmd3Q99LE3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Lysmd3Q99LE3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Lysmd3Q99LE3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61,5 ms