Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD4

Vangl2, Vang-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl2Q91ZD4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Vangl2Q91ZD4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Vangl2Q91ZD4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Vangl2Q91ZD4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Vangl2Q91ZD4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Vangl2Q91ZD4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Vangl2Q91ZD4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Vangl2Q91ZD4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Vangl2Q91ZD4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Vangl2Q91ZD4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Vangl2Q91ZD4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Vangl2Q91ZD4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Vangl2Q91ZD4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Vangl2Q91ZD4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Vangl2Q91ZD4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Vangl2Q91ZD4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Vangl2Q91ZD4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Vangl2Q91ZD4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Vangl2Q91ZD4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Vangl2Q91ZD4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Vangl2Q91ZD4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Vangl2Q91ZD4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Vangl2Q91ZD4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Vangl2Q91ZD4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Vangl2Q91ZD4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Vangl2Q91ZD4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Vangl2Q91ZD4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Vangl2Q91ZD4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Vangl2Q91ZD4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Vangl2Q91ZD4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Vangl2Q91ZD4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Vangl2Q91ZD4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Vangl2Q91ZD4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Vangl2Q91ZD4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Vangl2Q91ZD4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Vangl2Q91ZD4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Vangl2Q91ZD4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Vangl2Q91ZD4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Vangl2Q91ZD4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Vangl2Q91ZD4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Vangl2Q91ZD4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Vangl2Q91ZD4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Vangl2Q91ZD4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Vangl2Q91ZD4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vangl2Q91ZD4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Vangl2Q91ZD4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Vangl2Q91ZD4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Vangl2Q91ZD4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Vangl2Q91ZD4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Vangl2Q91ZD4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Vangl2Q91ZD4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Vangl2Q91ZD4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vangl2Q91ZD4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Vangl2Q91ZD4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Vangl2Q91ZD4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Vangl2Q91ZD4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Vangl2Q91ZD4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Vangl2Q91ZD4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Vangl2Q91ZD4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Vangl2Q91ZD4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Vangl2Q91ZD4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vangl2Q91ZD4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Vangl2Q91ZD4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Vangl2Q91ZD4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Vangl2Q91ZD4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Vangl2Q91ZD4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vangl2Q91ZD4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vangl2Q91ZD4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vangl2Q91ZD4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vangl2Q91ZD4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vangl2Q91ZD4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vangl2Q91ZD4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vangl2Q91ZD4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vangl2Q91ZD4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vangl2Q91ZD4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vangl2Q91ZD4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Vangl2Q91ZD4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vangl2Q91ZD4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vangl2Q91ZD4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Vangl2Q91ZD4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Vangl2Q91ZD4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Vangl2Q91ZD4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vangl2Q91ZD4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vangl2Q91ZD4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vangl2Q91ZD4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vangl2Q91ZD4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Vangl2Q91ZD4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vangl2Q91ZD4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vangl2Q91ZD4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vangl2Q91ZD4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vangl2Q91ZD4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vangl2Q91ZD4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vangl2Q91ZD4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vangl2Q91ZD4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vangl2Q91ZD4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vangl2Q91ZD4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vangl2Q91ZD4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vangl2Q91ZD4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vangl2Q91ZD4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Vangl2Q91ZD4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145 ms