RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555916.1

AC005480.1-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC005480.1, Length 3,548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005480.1-202ENST00000555916 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.4□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.4□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 WWP1Q9H0M0 922 aa6.4□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 RSAD1Q9HA92 442 aa6.4□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TMEM165Q9HC07 324 aa6.4□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.4□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 KLK14Q9P0G3 267 aa6.4□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 BPTFQ12830 3046 aa6.4□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 A0A0U1RQF3 1178 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 NEMP1O14524 444 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 COQ9O75208 318 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TIPRLO75663 272 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 NCAM1P13591 858 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 SAT1P21673 171 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 PROZP22891 400 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 MYL6P60660 151 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 DPYSL3Q14195 570 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 PSMD6Q15008 389 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 DESI1Q6ICB0 168 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 BADQ92934 168 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 DERAQ9Y315 318 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 E9PBE3 544 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 AIM2O14862 343 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 ITM2AO43736 263 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 KLHL41O60662 606 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 KRT37O76014 449 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TM7SF2O76062 418 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 RECQL4O94761 1208 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 VAV1P15498 845 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 CSF2RAP15509 400 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TNFSF9P41273 254 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TSPAN7P41732 249 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 GRIA2P42262 883 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 MAP7Q14244 749 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 CYTH1Q15438 398 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 ZACNQ401N2 412 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 CES3Q6UWW8 571 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TFAP2BQ92481 460 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 CGRRF1Q99675 332 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 BCO2Q9BYV7 579 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 CEP41Q9BYV8 373 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 PNPOQ9NVS9 261 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 PF4V1P10720 104 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 SYN1P17600 705 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 MMP8P22894 467 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 GRIA1P42261 906 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 SNX16P57768 344 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 ACTR3P61158 418 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 ROR1Q01973 937 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 GK3PQ14409 553 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 PDK3Q15120 406 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 ATG16L1Q676U5 607 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 WDR49Q8IV35 697 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 UBA3Q8TBC4 463 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF398Q8TD17 642 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 TMEM74Q96NL1 305 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005480.1-202ENST00000555916 CCDC78A2IDD5 438 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms