RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HACD1B0YJ81 288 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 COL6A2P12110 1019 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ERCC2P18074 760 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MGAT1P26572 445 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SDC4P31431 198 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R39P59534 338 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CUL3Q13618 768 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 VGLL4Q14135 290 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MUM1Q2TAK8 710 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KDELC1Q6UW63 502 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM131BQ86XD5 332 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS52Q8N1B4 723 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 AGAP3Q96P47 875 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSS2Q9NR19 701 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GMEB1Q9Y692 573 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 USP12O75317 370 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CD6P30203 668 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH1A3P47895 512 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NAGLUP54802 743 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 XAF1Q6GPH4 301 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHDC10Q6PID8 442 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf228Q6PIY5 440 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 POTEHQ6S545 545 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SPRED1Q7Z699 444 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LCA5Q86VQ0 697 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA24Q86W54 205 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX32Q86XE0 403 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SCML4Q8N228 414 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM156AQ8NDB6 213 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RCN3Q96D15 328 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PGBD4Q96DM1 585 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NT5C1AQ9BXI3 368 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOJQ9H4E5 214 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GSTO2Q9H4Y5 243 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB26Q9ULW5 256 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RAP2CQ9Y3L5 183 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0C4DFX4 3053 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A096LPK6 155 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM114B3SHH9 223 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 B4GALT3O60512 393 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 IQCCQ4KMZ1 466 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 IL23RQ5VWK5 629 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP4R4Q6NUP7 873 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CES3Q6UWW8 571 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOT1Q86TX2 421 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD6Q8NC69 237 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52K1Q8NGK4 314 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP41Q9BYV8 373 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM49BQ9NUQ9 324 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM181Q9P2C4 612 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TCAF1Q9Y4C2 921 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR32O75388 356 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL2O95198 593 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PGK2P07205 417 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPN3P20807 821 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS7P49802 495 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF33AQ06730 810 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HADHQ16836 314 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM117BQ6P1L5 589 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM81AQ8TBF8 368 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SPPL2BQ8TCT7 592 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF139Q8WU17 664 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TOP1MTQ969P6 601 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ITFG2Q969R8 447 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FEM1CQ96JP0 617 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FERMT1Q9BQL6 677 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TCF7L2Q9NQB0 619 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TCRBV5S2A0A599 114 aa3.68□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 E9PBE3 544 aa3.68□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL41O60662 606 aa3.68□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBED1O96006 694 aa3.68□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 EPHX2P34913 555 aa3.68□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.68□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
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