RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 AKT2P31751 481 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ADRA1BP35368 520 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 PTGER4P35408 488 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 NOP2P46087 812 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 PSMD8P48556 350 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ARSDP51689 593 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 MNAT1P51948 309 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ADKP55263 362 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 PER3P56645 1201 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CLDN2P57739 230 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 KRTAP10-9P60411 292 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ST8SIA6P61647 398 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 COG7P83436 770 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 NUCB1Q02818 461 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CDC20Q12834 499 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 MAPK7Q13164 816 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 C1orf61Q13536 156 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 FZD2Q14332 565 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 NR6A1Q15406 480 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 KMT5BQ4FZB7 885 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 C14orf28Q4W4Y0 310 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 BMP2KLQ5H9B9 411 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 C10orf120Q5SQS8 335 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 C9orf64Q5T6V5 341 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ADALQ6DHV7 355 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 RINT1Q6NUQ1 792 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 KLHDC10Q6PID8 442 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 Q6ZUG5 572 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC80Q76M96 950 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 LIMS2Q7Z4I7 341 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CDH24Q86UP0 819 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 TRIM69Q86WT6 500 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 NT5DC4Q86YG4 428 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 DENND1CQ8IV53 801 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 RASEFQ8IZ41 740 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 STK40Q8N2I9 435 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 TXLNBQ8N3L3 684 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CPXM2Q8N436 756 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 LRRC52Q8N7C0 313 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 PAF1Q8N7H5 531 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 C1orf127Q8N9H9 656 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM145Q8NBT3 493 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 UBXN4Q92575 508 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 BRF1Q92994 677 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ZBTB9Q96C00 473 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 C19orf60Q96EN9 201 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 BMFQ96LC9 184 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 AIFM3Q96NN9 605 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 NOX5Q96PH1 765 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CRACR2AQ9BSW2 395 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 RUSC1Q9BVN2 902 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 B3GNT5Q9BYG0 378 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 DCLK3Q9C098 648 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ELOVL4Q9GZR5 314 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM60Q9H2L4 133 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ZHX3Q9H4I2 956 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 SLAMF7Q9NQ25 335 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ABCB8Q9NUT2 735 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 EXOC1Q9NV70 894 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 OSER1Q9NX31 292 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 RABGEF1Q9UJ41 708 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ODF2LQ9ULJ1 636 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 RNF215Q9Y6U7 377 aa2.5□□□□□ -2.01
SNORD53-201ENST00000579969 ZGRF1Q86YA3 2104 aa2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms