RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 NDE1Q9NXR1 346 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 MAGEB16A2A368 324 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 DCXO43602 365 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TIMM44O43615 452 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 GNAT1P11488 350 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 NMBRP28336 390 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 NPY2RP49146 381 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 EPHB1P54762 984 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 MAP2K5Q13163 448 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 IRGCQ6NXR0 463 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 RAPH1Q70E73 1250 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 USP33Q8TEY7 942 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CMTM5Q96DZ9 223 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 VPS39Q96JC1 886 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TEKT5Q96M29 485 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 VAT1Q99536 393 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 UNCXA6NJT0 531 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 E9PBE3 544 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 KLHL41O60662 606 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 PEX6Q13608 980 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CLEC14AQ86T13 490 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CDH19Q9H159 772 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CDH9Q9ULB4 789 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TSC2P49815 1807 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CENPFP49454 3210 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 HHLA1C9JL84 531 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 PDE5AO76074 875 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 LINGO3P0C6S8 592 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CXCR3P49682 368 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TUBP50607 506 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CDH17Q12864 832 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 PRPSAP1Q14558 356 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 MIOSQ9NXC5 875 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 RRN3Q9NYV6 651 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.86■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 M0QZ92 97 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TRIM13O60858 407 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 MORN1Q5T089 497 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TAC4Q86UU9 113 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 APBA2Q99767 749 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 GPAMQ9HCL2 828 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 YY1P25490 414 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 PGGT1BP53609 377 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 MYLPFQ96A32 169 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 MOCOSQ96EN8 888 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TASP1Q9H6P5 420 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 ACSS2Q9NR19 701 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.85■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 GLTPD2A6NH11 291 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 DFFAO00273 331 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 ZMPSTE24O75844 475 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 SCNN1GP51170 649 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CUL3Q13618 768 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 GRM3Q14832 879 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 SPRYD7Q5W111 196 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 EPGNQ6UW88 154 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 IZUMO2Q6UXV1 221 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 SIK2Q9H0K1 926 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TLK1Q9UKI8 766 aa20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 ARL5CA6NH57 179 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TMEM114B3SHH9 223 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CTSHP09668 335 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 BDNFP23560 247 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 FSCBQ5H9T9 825 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CNTD1Q8N815 330 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 TK2O00142 265 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB14O43829 449 aa20.83■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 FKBP6O75344 327 aa20.83■□□□□ 0.93
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