RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 CHST12Q9NRB3 414 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 GIMAP2Q9UG22 337 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 SNX13Q9Y5W8 968 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 JCHAINP01591 159 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 UGT1A6P19224 532 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 CEACAM7Q14002 265 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 GRM3Q14832 879 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 AFG1LQ8WV93 481 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 EME1Q96AY2 570 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 NMRAL1Q9HBL8 299 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 GALNT8Q9NY28 637 aa17.72■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 SCN1AP35498 2009 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM149AA5PLN7 773 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 KCNU1A8MYU2 1149 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 MPP1Q00013 466 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 GHRHRQ02643 423 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 DGKDQ16760 1214 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF34Q969K3 372 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 OSMRQ99650 979 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 PNPLA8Q9NP80 782 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 DCDC2Q9UHG0 476 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 C9IYK1 514 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 IRF6O14896 467 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 CLIC3O95833 236 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 MT-ND1P03886 318 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 GJA9P57773 515 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 VGLL4Q14135 290 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 PCSK7Q16549 785 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 GSTA3Q16772 222 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGAP17Q68EM7 881 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 OR9I1Q8NGQ6 314 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 URGCPQ8TCY9 931 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 CDH19Q9H159 772 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 TLK1Q9UKI8 766 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 GJD2Q9UKL4 321 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 VANGL2Q9ULK5 521 aa17.71■□□□□ 0.43
KCNQ1-201ENST00000155840 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 MYLK3Q32MK0 819 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 KLHDC10Q6PID8 442 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 NT5DC4Q86YG4 428 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF139Q8WU17 664 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 C2orf40Q9H1Z8 148 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 CKMT2P17540 419 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 TKTP29401 623 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 GP5P40197 560 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 MAP3K7CLP57077 242 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP1R3AQ16821 1122 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 ARCQ7LC44 396 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 ZFP28Q8NHY6 868 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 ACTRT2Q8TDY3 377 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 KLHL32Q96NJ5 620 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 CIB1Q99828 191 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF39Q9H2S5 420 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 SETD4Q9NVD3 440 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 CROCCQ5TZA2 2017 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 KLHL33A6NCF5 533 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 ADM5C9JUS6 153 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 BIRC5O15392 142 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 IL23RQ5VWK5 629 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 IFNEQ86WN2 208 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF169Q8NCN4 708 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 IPMKQ8NFU5 416 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR41Q9HAD4 459 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 SPON1Q9HCB6 807 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 TNFSF13BQ9Y275 285 aa17.7■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF195O14628 629 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 SUPT3HO75486 399 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 MTX3Q5HYI7 312 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 CATSPER4Q7RTX7 472 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 PIGZQ86VD9 579 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIML2Q8N7C3 387 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF831Q5JPB2 1677 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 DFFAO00273 331 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIM13O60858 407 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 GCATO75600 419 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 VAPBO95292 243 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 TFAP2AP05549 437 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 PGAM1P18669 254 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 NFKB1P19838 968 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 MAP3K10Q02779 954 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 MPP3Q13368 585 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 MAP7Q14244 749 aa17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1-201ENST00000155840 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms