RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	PHO87	P25360	923 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	YRF1-6	P53819	1859 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	APC1	P53886	1748 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	SSN3	P39073	555 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	SUM1	P46676	1062 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	YDL176W	Q12027	708 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	ENT1	Q12518	454 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	SWI5	P08153	709 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	GAL2	P13181	574 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	HAP4	P14064	554 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	TGL4	P36165	910 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	OSH7	P38755	437 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	YPQ2	Q06328	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	HIM1	Q06674	414 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	YPL062W	Q02781	134 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	GAS4	Q08271	471 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	MCM1	P11746	286 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
PPQ1	YPL179W	NTH2	P35172	780 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	UBP1	P25037	809 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	SCT1	P32784	759 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	SLA1	P32790	1244 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	SNF2	P22082	1703 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	KTR7	P40504	517 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	TAP42	Q04372	366 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	SLM3	Q12093	417 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	PUP1	P25043	261 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	JJJ2	P46997	583 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	UBP15	P50101	1230 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	CAF120	P53836	1060 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	RSF2	P46974	1380 aa		5	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	CYT1	P07143	309 aa		5	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	YIR007W	P40566	764 aa		5	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	ROG3	P43602	733 aa		5	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	ROM1	P53046	1155 aa		5	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		5	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	XKS1	P42826	600 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	GRX4	P32642	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	ECM23	Q02710	187 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	CCP1	P00431	361 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	IRE1	P32361	1115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	VAN1	P23642	535 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	DOT5	P40553	215 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PPQ1	YPL179W	SIR4	P11978	1358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	RIM15	P43565	1770 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	TRS33	Q99394	268 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	UBX7	P38349	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	PSH1	Q12161	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	SCD5	P34758	872 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	HXT5	P38695	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	LYS5	P50113	272 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	DSD1	P53095	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	DIT1	P21623	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	YKL133C	P36066	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	CWH41	P53008	833 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	YNL165W	P53891	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	CUZ1	P53899	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	DPH6	Q12429	685 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	SUV3	P32580	737 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.3 ms