RNA–Protein interactions for RNA: YOR304W

ISW2, Transcript of ATP-dependent DNA translocase involved in chromatin remodeling, yeast

Gene ISW2, Length 3,363 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ISW2	YOR304W	SRF1	Q12516	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	RAM1	P22007	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	DUR3	P33413	735 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	MRPL33	P20084	86 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	VID27	P40157	782 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	RGD2	P43556	714 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	YNL034W	P53963	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	YNL018C	P53976	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	SPO20	Q04359	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	NPR1	P22211	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	ATG16	Q03818	150 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	SAM37	P50110	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	BSC2	Q05611	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	HIR1	P32479	840 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	HXT13	P39924	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	HXT17	P53631	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	HXT15	P54854	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	DAL4	Q04895	635 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	ISU2	Q12056	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	ATP4	P05626	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	FMP25	Q08023	583 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	MEF1	P25039	761 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	BDP1	P46678	594 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	NMA111	P53920	997 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	YKL222C	P35995	705 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	YHL008C	P38750	627 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	ALR1	Q08269	859 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	MOD5	P07884	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	TPD3	P31383	635 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	YGR237C	P50089	785 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	MCD1	Q12158	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ISW2	YOR304W	DAL5	P15365	543 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	YBR071W	P38243	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	MRPS18	P42847	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	HXT10	P43581	546 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	YJR115W	P47152	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	ENT2	Q05785	613 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	RRI2	Q12348	645 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	FLP1	P03870	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	ULP1	Q02724	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	ATG20	Q07528	640 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	OXR1	Q08952	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	VMA3	P25515	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	EUG1	P32474	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	NIT1	P40447	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	TFB2	Q02939	513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	KIP2	P28743	706 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	PLC1	P32383	869 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
ISW2	YOR304W	HXT8	P40886	569 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	YNL165W	P53891	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	MSB4	Q12317	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	ERP4	Q12450	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	MPD2	Q99316	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	RPN12	P32496	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	RKM3	P38222	552 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	EXO84	P38261	753 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	VBA5	P36172	582 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	YNL193W	P53870	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	UGO1	Q03327	502 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	PEX29	Q03370	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	ADI1	Q03677	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	SHE9	Q04172	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	THI73	Q07904	523 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	HIF1	Q12373	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	AGP1	P25376	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ISW2	YOR304W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.8 ms