RNA–Protein interactions for RNA: YML077W

BET5, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene BET5, Length 480 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BET5	YML077W	NTA1	P40354	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BET5	YML077W	SAM37	P50110	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BET5	YML077W	ALD3	P54114	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BET5	YML077W	BSC2	Q05611	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BET5	YML077W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	CYC8	P14922	966 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	RPC31	P17890	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	KAP122	P32767	1081 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	PSY2	P40164	858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	YGR122W	P53272	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	VPS16	Q03308	798 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	PSH1	Q12161	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	IRE1	P32361	1115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	PEP7	P32609	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	VAC8	P39968	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	COB	P00163	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	NNF1	P47149	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	MTO1	P53070	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	CTR9	P89105	1077 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	RMD1	Q03441	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	PIN2	Q12057	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	FLP1	P03870	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	RAD2	P07276	1031 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	UGA4	P32837	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	TAT1	P38085	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	GIP1	P38229	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	FIR1	P40020	876 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	YTA6	P40328	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	LSB6	P42951	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	DAL4	Q04895	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	OXR1	Q08952	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	DUR3	P33413	735 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	MAC1	P35192	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	ISW1	P38144	1129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	MAD1	P40957	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	YHL008C	P38750	627 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	MCA1	Q08601	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	PET112	P33893	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	ITC1	P53125	1264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	YNR040W	P53736	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BET5	YML077W	RGP1	P16664	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	MRPL16	P38064	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	AIM46	P38885	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	IOC3	P43596	787 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	SKP1	P52286	194 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	MON1	P53129	644 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	CLN2	P20438	545 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	YIL165C	P40446	119 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	DUT1	P33317	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	MNR2	P35724	969 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	PIC2	P40035	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	ULP1	Q02724	621 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	MRPS18	P42847	217 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	NUT1	P53114	1132 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	MCD1	Q12158	566 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	TAT2	P38967	592 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	CWC24	P53769	259 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	ADI1	Q03677	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	IOC4	Q04213	475 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	CDC34	P14682	295 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	YBR287W	P38355	427 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	APM2	P38700	605 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	PRY1	P47032	299 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BET5	YML077W	GCR1	P07261	785 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BET5	YML077W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BET5	YML077W	RIM11	P38615	370 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BET5	YML077W	SAP155	P43612	1002 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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