RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 POGKQ9P215 609 aa22.42■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 ADGRB2O60241 1585 aa22.42■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 IFT172Q9UG01 1749 aa22.41■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.4■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.39■■□□□ 1.18
NELFE-204ENST00000436289 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 SPON1Q9HCB6 807 aa22.38■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.37■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 PDE3BQ13370 1112 aa22.36■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.36■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 BARGINQ6ZT62 677 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 DLC1Q96QB1 1528 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-204ENST00000436289 KCNQ2O43526 872 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-204ENST00000436289 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NELFE-204ENST00000436289 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NELFE-204ENST00000436289 ALS2Q96Q42 1657 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-204ENST00000436289 EVA1CP58658 441 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-204ENST00000436289 STRN4Q9NRL3 753 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-204ENST00000436289 KIAA0232Q92628 1395 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-204ENST00000436289 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NELFE-204ENST00000436289 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NELFE-204ENST00000436289 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-204ENST00000436289 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NELFE-204ENST00000436289 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-204ENST00000436289 CHRNA2Q15822 529 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-204ENST00000436289 USP35Q9P2H5 1018 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-204ENST00000436289 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-204ENST00000436289 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-204ENST00000436289 RREB1Q92766 1687 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-204ENST00000436289 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-204ENST00000436289 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NELFE-204ENST00000436289 PLSCR1O15162 318 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-204ENST00000436289 STAC3Q96MF2 364 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-204ENST00000436289 SSH2Q76I76 1423 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-204ENST00000436289 ATP7BP35670 1465 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-204ENST00000436289 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-204ENST00000436289 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-204ENST00000436289 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NELFE-204ENST00000436289 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NELFE-204ENST00000436289 CPDO75976 1380 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-204ENST00000436289 ADGRB1O14514 1584 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-204ENST00000436289 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 ABTB2Q8N961 1025 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 NLRP13Q86W25 1043 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NELFE-204ENST00000436289 ITSN1Q15811 1721 aa22.08■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 ACEP12821 1306 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 GCP02774 474 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 DDB1Q16531 1140 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 CDK19Q9BWU1 502 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 USP19O94966 1318 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 CRB1P82279 1406 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 C1QTNF8P60827 252 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 PTGER2P43116 358 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 SYT17Q9BSW7 474 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 ZBTB7AO95365 584 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 STK32BQ9NY57 414 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-204ENST00000436289 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 BCL9O00512 1426 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 PROM2Q8N271 834 aa22■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.99■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 IFFO2Q5TF58 517 aa21.99■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 MTFR1LQ9H019 292 aa21.99■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.99■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 CASZ1Q86V15 1759 aa21.98■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 SLC15A2Q16348 729 aa21.98■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 UTRNP46939 3433 aa21.97■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.97■■□□□ 1.11
NELFE-204ENST00000436289 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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