RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174831.7

Ptprd-220, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ptprd, Length 4,518 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa8.48□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Kdm5cP41230 1554 aa8.47□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Fchsd2Q3USJ8 740 aa8.47□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa8.47□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Card10P58660 1021 aa8.47□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Lrrc7Q80TE7 1490 aa8.47□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 NexnQ7TPW1 607 aa8.46□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gnai1B2RSH2 354 aa8.46□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ppp1r15aP17564 657 aa8.46□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Amotl2Q8K371 772 aa8.46□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gnai3Q9DC51 354 aa8.46□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Dnai2A2AC93 623 aa8.46□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Asxl2Q8BZ32 1370 aa8.45□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Fam50bQ9WTJ8 334 aa8.45□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ncoa1P70365 1447 aa8.45□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Chmp3Q9CQ10 224 aa8.45□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Swt1Q9DBQ9 907 aa8.45□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ofd1Q80Z25 1017 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Bicdl1A0JNT9 577 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cnnm1Q0GA42 951 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 CastP51125 788 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ddx11Q6AXC6 880 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Zcwpw1Q6IR42 630 aa8.43□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 MpndQ3TV65 487 aa8.43□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Setd1bQ8CFT2 1985 aa8.43□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ncoa4Q5U4H9 625 aa8.42□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Pde4bB1AWC9 736 aa8.42□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Vps33bP59016 617 aa8.42□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Smarcc1P97496 1104 aa8.42□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa8.42□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ralbp1Q62172 648 aa8.42□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Knl1Q66JQ7 1612 aa8.42□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 MpripP97434 1024 aa8.42□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Lrrc43Q3V0L5 667 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 OptnQ8K3K8 584 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Txnrd1Q9JMH6 613 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Dnajc10Q9DC23 793 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Stard3nlQ9DCI3 235 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Abca6Q8K441 1624 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 PaskQ8CEE6 1383 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rims1Q99NE5 1463 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 KdrP35918 1367 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cavin4A2AMM0 362 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Pibf1E9Q6K3 756 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Dnajc5gQ8C632 165 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Psrc1Q9D0P7 329 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Uggt1Q6P5E4 1551 aa8.4□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ccne1Q61457 408 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 CrklP47941 303 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Idi1P58044 227 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Nphp4P59240 1425 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Trim34bJ3QNR8 485 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Sik1Q60670 779 aa8.38□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Tceal9Q9DD24 104 aa8.38□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Robo2Q7TPD3 1470 aa8.38□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Plekhg5Q66T02 1073 aa8.38□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Tmco5bQ80X59 307 aa8.38□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Abca9Q8K449 1623 aa8.37□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 St5Q924W7 1134 aa8.37□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Prdm11A2AGX3 565 aa8.37□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ksr2Q3UVC0 959 aa8.37□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Btbd11Q6GQW0 1109 aa8.37□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa8.37□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Amotl1Q9D4H4 968 aa8.37□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa8.37□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rwdd1Q9CQK7 243 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ankrd23Q812A3 306 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 IncenpQ9WU62 880 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Tmem2Q5FWI3 1383 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa8.35□□□□□ -1.07
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.4 ms