RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000072312.11

Usp13-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp13, Length 7,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13-201ENSMUST00000072312 Dydc1Q9D9T0 175 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Spag5Q7TME2 1165 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Speer4bQ9D9F7 267 aa14.73□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 PdiltQ9DAN1 588 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Fez1Q8K0X8 392 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Eif3j2Q66JS6 263 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Cfap57Q9D180 1249 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Nap1l2P51860 460 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Ift57Q8BXG3 429 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Phldb2Q8K1N2 1249 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Paip2Q9D6V8 124 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 CastP51125 788 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Lrrfip2Q91WK0 415 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa14.71□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Psmd1Q3TXS7 953 aa14.71□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 NexnQ7TPW1 607 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Ccnb3Q810T2 1396 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Arid3aQ62431 601 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Pip4k2aO70172 405 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Cnnm1Q0GA42 951 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 PdcQ9QW08 244 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Trap1aP19473 224 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Erc1Q99MI1 1120 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Ccdc60Q8C4J0 545 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Lamb3Q61087 1168 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 IqcgQ80W32 419 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Acbd3Q8BMP6 525 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 ErbinQ80TH2 1402 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Tango6Q8C3S2 1079 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 CenpqQ9CPQ5 267 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 MicalclQ9D5U9 680 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Fmn1Q05860 1466 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gsto1O09131 240 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 TchpQ3TVW5 497 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Exoc8Q6PGF7 716 aa14.67□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa14.67□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Stim1P70302 685 aa14.67□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Wdhd1P59328 1117 aa14.67□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Pank3Q8R2W9 370 aa14.67□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa14.66□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 4933428M09RikQ9D3X3 192 aa14.66□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa14.66□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gm7361D3Z6R1 267 aa14.66□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa14.66□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gm1979E9QAN3 267 aa14.66□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gm5862K7N5V5 267 aa14.66□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gm10220K7N660 267 aa14.66□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Arhgap35Q91YM2 1499 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Mnat1P51949 309 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gm18336A0A140LIU8 765 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Tdrd9Q14BI7 1383 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Tspyl3Q3UYP3 334 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 AdnpQ9Z103 1108 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Cchcr1Q8K2I2 770 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp13-201ENSMUST00000072312 Tmc1Q8R4P5 757 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Strn4P58404 760 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Hmox1P14901 289 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gtf2a1Q99PM3 378 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Ercc3P49135 783 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Babam1Q3UI43 333 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 CntlnA2AM05 1397 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Soga3Q6NZL0 945 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Otud6bQ8K2H2 294 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Fbf1A2A870 1173 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Cetn4Q8K4K1 168 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 TefQ9JLC6 301 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 ApobrQ8VBT6 942 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Gimap5Q8BWF2 308 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Rab3il1Q8VDV3 383 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 GlmnQ8BZM1 596 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Pde4bB1AWC9 736 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Als2cr12Q8BVM7 383 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 UacaQ8CGB3 1411 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Ankrd24Q80VM7 985 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp13-201ENSMUST00000072312 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.1 ms