Protein–RNA interactions for Protein: Q66JS6

Eif3j2, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j2Q66JS6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,39■■■■■ 4,54
Eif3j2Q66JS6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,05■■■■■ 4
Eif3j2Q66JS6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Eif3j2Q66JS6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,07■■■■□ 3,68
Eif3j2Q66JS6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Eif3j2Q66JS6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,54■■■■□ 3,6
Eif3j2Q66JS6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,26■■■■□ 3,56
Eif3j2Q66JS6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,55
Eif3j2Q66JS6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Eif3j2Q66JS6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Eif3j2Q66JS6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Eif3j2Q66JS6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Eif3j2Q66JS6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,26■■■■□ 3,4
Eif3j2Q66JS6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
Eif3j2Q66JS6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Eif3j2Q66JS6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,53■■■■□ 3,28
Eif3j2Q66JS6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Eif3j2Q66JS6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Eif3j2Q66JS6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Eif3j2Q66JS6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Eif3j2Q66JS6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Eif3j2Q66JS6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,03■■■■□ 3,2
Eif3j2Q66JS6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Eif3j2Q66JS6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Eif3j2Q66JS6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Eif3j2Q66JS6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Eif3j2Q66JS6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Eif3j2Q66JS6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,75■■■■□ 3,15
Eif3j2Q66JS6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,75■■■■□ 3,15
Eif3j2Q66JS6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Eif3j2Q66JS6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,53■■■■□ 3,12
Eif3j2Q66JS6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Eif3j2Q66JS6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Eif3j2Q66JS6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Eif3j2Q66JS6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Eif3j2Q66JS6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,18■■■■□ 3,06
Eif3j2Q66JS6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Eif3j2Q66JS6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Eif3j2Q66JS6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Eif3j2Q66JS6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Eif3j2Q66JS6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Eif3j2Q66JS6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Eif3j2Q66JS6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Eif3j2Q66JS6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Eif3j2Q66JS6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Eif3j2Q66JS6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Eif3j2Q66JS6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Eif3j2Q66JS6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Eif3j2Q66JS6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Eif3j2Q66JS6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Eif3j2Q66JS6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,39■■■□□ 2,94
Eif3j2Q66JS6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,93
Eif3j2Q66JS6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Eif3j2Q66JS6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Eif3j2Q66JS6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Eif3j2Q66JS6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Eif3j2Q66JS6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Eif3j2Q66JS6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Eif3j2Q66JS6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Eif3j2Q66JS6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Eif3j2Q66JS6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Eif3j2Q66JS6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Eif3j2Q66JS6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Eif3j2Q66JS6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Eif3j2Q66JS6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Eif3j2Q66JS6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,7■■■□□ 2,83
Eif3j2Q66JS6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Eif3j2Q66JS6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,69■■■□□ 2,82
Eif3j2Q66JS6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Eif3j2Q66JS6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Eif3j2Q66JS6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,66■■■□□ 2,82
Eif3j2Q66JS6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Eif3j2Q66JS6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Eif3j2Q66JS6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Eif3j2Q66JS6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Eif3j2Q66JS6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Eif3j2Q66JS6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Eif3j2Q66JS6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Eif3j2Q66JS6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Eif3j2Q66JS6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Eif3j2Q66JS6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,33■■■□□ 2,77
Eif3j2Q66JS6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Eif3j2Q66JS6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,27■■■□□ 2,76
Eif3j2Q66JS6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Eif3j2Q66JS6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Eif3j2Q66JS6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Eif3j2Q66JS6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Eif3j2Q66JS6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32,12■■■□□ 2,73
Eif3j2Q66JS6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Eif3j2Q66JS6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Eif3j2Q66JS6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Eif3j2Q66JS6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Eif3j2Q66JS6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Eif3j2Q66JS6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Eif3j2Q66JS6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Eif3j2Q66JS6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Eif3j2Q66JS6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Eif3j2Q66JS6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Eif3j2Q66JS6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Eif3j2Q66JS6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,6 ms