RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641667.1

AP006294.2-201, humanhuman

BASIC

Gene AP006294.2, Length 209 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP006294.2-201ENST00000641667 ACSL4O60488 711 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 MAGEC1O60732 1142 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 CD70P32970 193 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 SAP25Q8TEE9 199 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 SLC39A7Q92504 469 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 TATDN2Q93075 761 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 SLC6A18Q96N87 628 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 CEP83Q9Y592 693 aa20.52■□□□□ 0.88
AP006294.2-201ENST00000641667 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 CAPN8A6NHC0 703 aa20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 LCP1P13796 627 aa20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 SLC8A1P32418 973 aa20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TBX4P57082 545 aa20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 SEMG2Q02383 582 aa20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 CUL2Q13617 745 aa20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 CDH18Q13634 790 aa20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 STIM2Q9P246 746 aa20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa20.51■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 A0A1W2PP55 124 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TLR4O00206 839 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TULP2O00295 520 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 SIN3BO75182 1162 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 ADH1BP00325 375 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 IGLV3-27P01718 113 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 GOT1P17174 413 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 C5AR1P21730 350 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 NUDT1P36639 197 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 CSKP41240 450 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 DAOAP59103 153 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 RTP5Q14D33 572 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 STILQ15468 1287 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 EID2Q8N6I1 236 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 UBA3Q8TBC4 463 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 SERAC1Q96JX3 654 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 HPSEQ9Y251 543 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TMEM131Q92545 1883 aa20.5■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 MID1O15344 667 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 FBXO21O94952 628 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 NUCB2P80303 420 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 SNX21Q969T3 373 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 SERPINB11Q96P15 392 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.49■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 KNL1Q8NG31 2342 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 PAEPP09466 180 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 CKMT2P17540 419 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 ACTN2P35609 894 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 RXRGP48443 463 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 SGSHP51688 502 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 ECT2LQ008S8 904 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 DPYDQ12882 1025 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 OVGP1Q12889 678 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 DNAJC3Q13217 504 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 HS1BP3Q53T59 392 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 HES3Q5TGS1 186 aa20.48■□□□□ 0.87
AP006294.2-201ENST00000641667 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms