RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 DKK3Q9UBP4 350 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 PLAAQ9Y263 795 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 HTTP42858 3142 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PQY0 241 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 H0YGN5 161 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 PRPSAP2O60256 369 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 FKTNO75072 461 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 ATP2C2O75185 946 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CCDC159P0C7I6 412 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CKBP12277 381 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 LCP1P13796 627 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 ATF2P15336 505 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 NPR3P17342 541 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 GNAZP19086 355 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 S100A1P23297 94 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 SDC4P31431 198 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 LHX1P48742 406 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 PRMT2P55345 433 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 RAB15P59190 212 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 USP46P62068 366 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 PLCB3Q01970 1234 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 GUCY1A3Q02108 690 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CAV1Q03135 178 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 ARHGEF6Q15052 776 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 TAF5Q15542 800 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 UPP1Q16831 310 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CDO1Q16878 200 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 NEPROQ6NW34 567 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 BBS12Q6ZW61 710 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 SLC26A9Q7LBE3 791 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 ARCQ7LC44 396 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 HOOK3Q86VS8 718 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CCDC89Q8N998 374 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 TTC13Q8NBP0 860 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 KCTD6Q8NC69 237 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 RNF169Q8NCN4 708 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 HSPH1Q92598 858 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CENPTQ96BT3 561 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 FAM136AQ96C01 138 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 ITPKCQ96DU7 683 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 SNF8Q96H20 258 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CFAP57Q96MR6 1250 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 DUSP16Q9BY84 665 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 HCSTQ9UBK5 93 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 NFS1Q9Y697 457 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CLDN5O00501 218 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 HRO43593 1189 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CST8O60676 142 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 KRT14P02533 472 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 ITGAVP06756 1048 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CD48P09326 243 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 ITIH2P19823 946 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 IVDP26440 423 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 KLRC2P26717 231 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 ADCY8P40145 1251 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 PTPN9P43378 593 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 VEGFBP49765 207 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 ARSEP51690 589 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 PMS2P54278 862 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 MTTPP55157 894 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 TUBA4AP68366 448 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 GSTA3Q16772 222 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 CCDC142Q17RM4 750 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms