RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 GIMAP7Q8NHV1 300 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ACAP3Q96P50 834 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS33BQ9H267 617 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LMCD1Q9NZU5 365 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX13Q9UN79 622 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA8SH3BPF8 625 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MLNP12872 115 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXC8P31273 242 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GRM5P41594 1212 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ARFIP2P53365 341 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SOWAHAQ2M3V2 549 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL38Q2WGJ6 581 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DHDDSQ86SQ9 333 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CPXCR1Q8N123 301 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRN4Q8WUT4 740 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GAB3Q8WWW8 586 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF670Q9BS34 389 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM55Q9BYV6 548 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNCQ9H7C4 482 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SARDHQ9UL12 918 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 VWA7Q9Y334 891 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GRID2O43424 1007 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 AP1G2O75843 785 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNB1P01574 187 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH3B2P48448 385 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MYBPC1Q00872 1141 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DLG2Q15700 870 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT3A2Q3SY77 523 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ALKAL1Q6UXT8 129 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP93Q8N1F7 819 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA18Q8TC71 538 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 APBB2Q92870 758 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP3.75□□□□□ -1.816e-6■■■■□ 23.1
PGGT1B-203ENST00000419445 ECSITQ9BQ95 431 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC77Q9BR77 488 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CNPY3Q9BT09 278 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RSAD1Q9HA92 442 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP205Q92621 2012 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0G2JND7 137 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 FZD9O00144 591 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 STAM2O75886 525 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LTFP02788 710 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CPA2P48052 419 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TREML2Q5T2D2 321 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PELI3Q8N2H9 469 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ST14Q9Y5Y6 855 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH2P05091 517 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP5P55064 265 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP4P55087 323 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJC24Q6P3W2 148 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PACS1Q6VY07 963 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP2A3Q93084 1043 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SMC6Q96SB8 1091 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 S100A14Q9HCY8 104 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 B2RBV5 119 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CLGNO14967 610 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 HCRTO43612 131 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT7P08729 469 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 AP3M2P53677 418 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A3Q00325 362 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT2Q10471 571 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYBG2Q8N1P7 616 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF217Q8TC41 542 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SLCO4A1Q96BD0 722 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 HAUS1Q96CS2 278 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RANBP9Q96S59 729 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 OLAHQ9NV23 265 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM216Q9P0N5 145 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGA11Q9UKX5 1188 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 C7orf72A4D263 438 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 H0YCG3 227 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPA1LP34931 641 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
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