RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 ITIH3Q06033 890 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CCDC14Q49A88 953 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CCDC89Q8N998 374 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 POM121Q96HA1 1249 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CNPY3Q9BT09 278 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LRCH4O75427 683 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DAB1O75553 588 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CYP2F1P24903 491 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GJC1P36383 396 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GRIK1P39086 918 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CLUL1Q15846 466 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LRRC38Q5VT99 294 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PLXNA3P51805 1871 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HSF2BPO75031 334 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FGGP02679 453 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CPB1P15086 417 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ARPP19P56211 112 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GIPC2Q8TF65 315 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HERVK_113Q902F9 699 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SPDL1Q96EA4 605 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SPG21Q9NZD8 308 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RNF8O76064 485 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GJB5O95377 273 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SOD2P04179 222 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 IVLP07476 585 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 USP17L7P0C7H9 530 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SDC4P31431 198 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PCK1P35558 622 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MAGEA11P43364 429 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PTPN9P43378 593 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DAOAP59103 153 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ELF2Q15723 593 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PSMD5Q16401 504 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KAZNQ674X7 775 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SIX5Q8N196 739 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SCML4Q8N228 414 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PLVAPQ9BX97 442 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CHST7Q9NS84 486 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MTRRQ9UBK8 725 aa6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 VNN2O95498 520 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZBED1O96006 694 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KRT1P04264 644 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GLI1P08151 1106 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 IL1R2P27930 398 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MIPP30301 263 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ATP11AP98196 1134 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SMARCB1Q12824 385 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GPR17Q13304 367 aa6.29□□□□□ -1.4
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