RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	CD101	Q93033	1021 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	PIDD1	Q9HB75	910 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	FANCG	O15287	622 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	DAB1	O75553	588 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	RNF8	O76064	485 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	SEC24A	O95486	1093 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	LTF	P02788	710 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	SDC4	P31431	198 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	FLT3	P36888	993 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	ALDH1A3	P47895	512 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	PPP3CC	P48454	512 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	RPS6KA1	Q15418	735 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	DDR2	Q16832	855 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	TRIM7	Q9C029	511 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CELF4-222	ENST00000601392	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392		E7ENQ6	273 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	RFPL2	O75678	378 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	FTCD	O95954	541 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	F9	P00740	461 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	FYN	P06241	537 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	PSMA2	P25787	234 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	YWHAQ	P27348	245 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	PEX5	P50542	639 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	AMPD2	Q01433	879 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	OGDH	Q02218	1023 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	TAF5	Q15542	800 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	EDA	Q92838	391 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	PBK	Q96KB5	322 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	NPY6R	Q99463	290 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	FAM170A	A1A519	330 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	PIK3R2	O00459	728 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	PSTPIP1	O43586	416 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	SPOP	O43791	374 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	PAPLN	O95428	1278 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	GJB6	O95452	261 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	KRT7	P08729	469 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	POU2F2	P09086	479 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	ATF6	P18850	670 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	HOXA9	P31269	272 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	EPHB3	P54753	998 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
CELF4-222	ENST00000601392	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.32	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms