RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRIT1O00522 736 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 TADA3O75528 432 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 HDAC4P56524 1084 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 DEUP1Q05D60 604 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTMR3Q13615 1198 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 STRADAQ7RTN6 431 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCTD6Q8NC69 237 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXO32Q969P5 355 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPY6RQ99463 290 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 AP1M1Q9BXS5 423 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAM33Q9BZ11 813 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCC13Q9NSE7 274 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCML2Q9UQR0 700 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PQH9 124 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC38A8A6NNN8 435 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 RARAP10276 462 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATF6P18850 670 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLD1Q13393 1074 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 LILRA6Q6PI73 481 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC149Q6ZUS6 474 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 MON1AQ86VX9 555 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAM32Q8TC27 787 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 PEBP4Q96S96 227 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 COMMD8Q9NX08 183 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 RRN3Q9NYV6 651 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 YIPF1Q9Y548 306 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1RP00736 705 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA31D3P0C874 917 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 RDXP35241 583 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 VEPH1Q14D04 833 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAF12Q16514 161 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRIT3Q3SXY7 679 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 BOLA3Q53S33 107 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 KREMEN2Q8NCW0 462 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF139Q8WU17 664 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAPGEF5Q92565 580 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 NT5C3BQ969T7 300 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLITRK1Q96PX8 696 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 HEMGNQ9BXL5 484 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM204AQ9H8W3 233 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 GMIPQ9P107 970 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXW11Q9UKB1 542 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 INSL5Q9Y5Q6 135 aa17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYO7AQ13402 2215 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPOPA6NHQ4 379 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RALAP11233 206 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 KDELR1P24390 212 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLCN4P51793 760 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TERF1P54274 439 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPHB3P54753 998 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAF10Q12962 218 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 KAZNQ674X7 775 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MFSD7Q6UXD7 560 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCD5Q86SK9 330 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM131BQ86XD5 332 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 NMUR1Q9HB89 426 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDIT4Q9NX09 232 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL37Q9NZH6 218 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYO9BQ13459 2157 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSH1P0DML2 217 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSH2P0DML3 217 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PGFP49763 221 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDH6P55285 790 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TWF1Q12792 350 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT81Q14533 505 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERMARDQ5T6L9 678 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CALN1Q9BXU9 219 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 OSBPL8Q9BZF1 889 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF576Q9H609 170 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUDT5Q9UKK9 219 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTIFO43310 598 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ENDOD1O94919 500 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 GBP1P32455 592 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 COPS2P61201 443 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TUBB4BP68371 445 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ITIH3Q06033 890 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TFDP3Q5H9I0 405 aa17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms