RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fbxw8Q8BIA4 598 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mrpl58Q8R035 206 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc29a1Q9JIM1 460 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Brwd3A2AHJ4 1799 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Adcy1O88444 1118 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Psmb4P99026 264 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1415Q7TQS4 311 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1416Q8VGU4 312 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Taf11Q99JX1 211 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mphosph6Q9D1Q1 161 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dgcr8Q9EQM6 773 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rnf19bA2A7Q9 732 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Armt1A6H630 439 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Plekha5E9Q6H8 1269 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Spata31E9QAF0 1014 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 MafgO54790 162 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 DesP31001 469 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arhgap45Q3TBD2 1116 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfm4Q3UZZ4 505 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dclk2Q6PGN3 756 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fam185aQ7TPD2 378 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wdr35Q8BND3 1181 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 TbcdQ8BYA0 1196 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr449Q8VGW8 311 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Adgrf4Q9D2L6 698 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Smad9Q9JIW5 430 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Iigp1Q9QZ85 413 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tk2Q9R088 270 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ptpn4Q9WU22 926 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ly6iQ9WU67 134 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 EpoP07321 192 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ccnd3P30282 292 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Drg1P32233 367 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mxd1P50538 227 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fam198aQ3UY90 562 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Xlr3cQ61806 226 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ptpn14Q62130 1189 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gdpd5Q640M6 607 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 WlsQ6DID7 541 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Atg9bQ6EBV9 922 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gabra5Q8BHJ7 463 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 SowahaQ8BLS7 548 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ppp4r4Q8C0Y0 875 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lrif1Q8CDD9 755 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zdhhc3Q8R173 299 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Trim42Q9D2H5 723 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cab39lQ9DB16 337 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 DgkeQ9R1C6 564 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 PapolbQ9WVP6 641 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cntnap4Q99P47 1310 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 PtgisO35074 501 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Magea6O89010 325 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 RnaselQ05921 735 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tcaf3Q6QR59 914 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Syne4Q8CII8 388 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Trpc2Q9R244 1172 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm7086A0A1W2P766 342 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Klf1P46099 358 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 PolgP54099 1218 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 YwhazP63101 245 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kcna2P63141 499 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pla2g6P97819 807 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pld5Q3UNN8 536 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 C6.1alQ7M757 291 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr389Q7TRX7 312 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mfsd5Q921Y4 450 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ap2b1Q9DBG3 937 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Acox2Q9QXD1 681 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 PigqQ9QYT7 581 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Taf1Q80UV9 1891 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 0610012G03RikA0A0J9YTR2 95 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1305A2AVW3 312 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rad51ap2G3UW63 976 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 E230025N22RikG5E8S3 482 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm43302L7N1X8 611 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hoxc6P10629 235 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nr2c2P49117 596 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arf4P61750 180 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fmo3P97501 534 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gbp10Q000W5 611 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Papss1Q60967 624 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kctd12Q6WVG3 327 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wscd1Q80XH4 572 aa11.84□□□□□ -0.51
Herc4-201ENSMUST00000020258 Adprhl2Q8CG72 370 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 103.8 ms