Protein–RNA interactions for Protein: P49117

Nr2c2, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2c2P49117 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Nr2c2P49117 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Nr2c2P49117 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Nr2c2P49117 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Nr2c2P49117 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Nr2c2P49117 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Nr2c2P49117 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Nr2c2P49117 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Nr2c2P49117 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Nr2c2P49117 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Nr2c2P49117 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Nr2c2P49117 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nr2c2P49117 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nr2c2P49117 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Nr2c2P49117 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nr2c2P49117 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nr2c2P49117 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nr2c2P49117 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nr2c2P49117 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nr2c2P49117 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Nr2c2P49117 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nr2c2P49117 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nr2c2P49117 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nr2c2P49117 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nr2c2P49117 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Nr2c2P49117 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nr2c2P49117 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nr2c2P49117 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nr2c2P49117 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nr2c2P49117 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nr2c2P49117 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nr2c2P49117 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nr2c2P49117 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nr2c2P49117 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nr2c2P49117 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nr2c2P49117 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nr2c2P49117 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Nr2c2P49117 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nr2c2P49117 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nr2c2P49117 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nr2c2P49117 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nr2c2P49117 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nr2c2P49117 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nr2c2P49117 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nr2c2P49117 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Nr2c2P49117 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nr2c2P49117 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nr2c2P49117 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nr2c2P49117 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nr2c2P49117 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nr2c2P49117 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nr2c2P49117 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nr2c2P49117 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nr2c2P49117 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nr2c2P49117 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nr2c2P49117 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nr2c2P49117 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nr2c2P49117 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nr2c2P49117 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nr2c2P49117 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Nr2c2P49117 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nr2c2P49117 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Nr2c2P49117 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nr2c2P49117 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nr2c2P49117 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Nr2c2P49117 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Nr2c2P49117 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nr2c2P49117 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nr2c2P49117 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nr2c2P49117 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Nr2c2P49117 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nr2c2P49117 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nr2c2P49117 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nr2c2P49117 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nr2c2P49117 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nr2c2P49117 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nr2c2P49117 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nr2c2P49117 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nr2c2P49117 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nr2c2P49117 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nr2c2P49117 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nr2c2P49117 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nr2c2P49117 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nr2c2P49117 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nr2c2P49117 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nr2c2P49117 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nr2c2P49117 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nr2c2P49117 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nr2c2P49117 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nr2c2P49117 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nr2c2P49117 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nr2c2P49117 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nr2c2P49117 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nr2c2P49117 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nr2c2P49117 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nr2c2P49117 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nr2c2P49117 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nr2c2P49117 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Nr2c2P49117 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nr2c2P49117 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms