Protein–RNA interactions for Protein: Q05921

Rnasel, 2-5A-dependent ribonuclease, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RnaselQ05921 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
RnaselQ05921 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RnaselQ05921 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RnaselQ05921 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RnaselQ05921 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RnaselQ05921 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RnaselQ05921 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RnaselQ05921 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RnaselQ05921 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RnaselQ05921 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
RnaselQ05921 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
RnaselQ05921 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RnaselQ05921 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RnaselQ05921 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RnaselQ05921 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RnaselQ05921 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RnaselQ05921 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RnaselQ05921 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
RnaselQ05921 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RnaselQ05921 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RnaselQ05921 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RnaselQ05921 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RnaselQ05921 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RnaselQ05921 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RnaselQ05921 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RnaselQ05921 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RnaselQ05921 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RnaselQ05921 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RnaselQ05921 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
RnaselQ05921 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RnaselQ05921 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RnaselQ05921 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RnaselQ05921 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RnaselQ05921 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RnaselQ05921 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RnaselQ05921 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RnaselQ05921 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RnaselQ05921 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RnaselQ05921 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RnaselQ05921 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RnaselQ05921 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RnaselQ05921 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RnaselQ05921 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RnaselQ05921 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RnaselQ05921 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RnaselQ05921 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RnaselQ05921 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RnaselQ05921 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RnaselQ05921 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RnaselQ05921 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RnaselQ05921 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RnaselQ05921 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RnaselQ05921 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RnaselQ05921 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RnaselQ05921 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RnaselQ05921 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RnaselQ05921 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RnaselQ05921 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RnaselQ05921 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RnaselQ05921 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RnaselQ05921 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RnaselQ05921 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RnaselQ05921 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RnaselQ05921 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RnaselQ05921 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RnaselQ05921 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RnaselQ05921 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RnaselQ05921 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RnaselQ05921 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RnaselQ05921 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RnaselQ05921 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RnaselQ05921 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RnaselQ05921 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RnaselQ05921 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RnaselQ05921 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RnaselQ05921 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RnaselQ05921 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RnaselQ05921 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RnaselQ05921 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RnaselQ05921 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RnaselQ05921 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RnaselQ05921 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RnaselQ05921 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RnaselQ05921 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RnaselQ05921 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RnaselQ05921 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RnaselQ05921 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RnaselQ05921 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RnaselQ05921 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RnaselQ05921 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RnaselQ05921 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RnaselQ05921 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RnaselQ05921 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RnaselQ05921 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RnaselQ05921 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RnaselQ05921 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RnaselQ05921 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RnaselQ05921 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RnaselQ05921 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RnaselQ05921 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms