Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG3

Ap2b1, AP-2 complex subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap2b1Q9DBG3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Ap2b1Q9DBG3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ap2b1Q9DBG3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ap2b1Q9DBG3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ap2b1Q9DBG3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ap2b1Q9DBG3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap2b1Q9DBG3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ap2b1Q9DBG3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Ap2b1Q9DBG3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap2b1Q9DBG3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap2b1Q9DBG3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ap2b1Q9DBG3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ap2b1Q9DBG3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ap2b1Q9DBG3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ap2b1Q9DBG3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ap2b1Q9DBG3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ap2b1Q9DBG3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap2b1Q9DBG3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap2b1Q9DBG3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ap2b1Q9DBG3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ap2b1Q9DBG3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap2b1Q9DBG3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ap2b1Q9DBG3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ap2b1Q9DBG3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ap2b1Q9DBG3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ap2b1Q9DBG3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ap2b1Q9DBG3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ap2b1Q9DBG3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap2b1Q9DBG3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ap2b1Q9DBG3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ap2b1Q9DBG3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap2b1Q9DBG3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ap2b1Q9DBG3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap2b1Q9DBG3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ap2b1Q9DBG3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap2b1Q9DBG3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap2b1Q9DBG3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap2b1Q9DBG3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap2b1Q9DBG3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap2b1Q9DBG3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap2b1Q9DBG3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ap2b1Q9DBG3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap2b1Q9DBG3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap2b1Q9DBG3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap2b1Q9DBG3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap2b1Q9DBG3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap2b1Q9DBG3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap2b1Q9DBG3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap2b1Q9DBG3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap2b1Q9DBG3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap2b1Q9DBG3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ap2b1Q9DBG3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ap2b1Q9DBG3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap2b1Q9DBG3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap2b1Q9DBG3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap2b1Q9DBG3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ap2b1Q9DBG3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap2b1Q9DBG3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap2b1Q9DBG3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap2b1Q9DBG3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ap2b1Q9DBG3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ap2b1Q9DBG3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ap2b1Q9DBG3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap2b1Q9DBG3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap2b1Q9DBG3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap2b1Q9DBG3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap2b1Q9DBG3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap2b1Q9DBG3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap2b1Q9DBG3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap2b1Q9DBG3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ap2b1Q9DBG3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap2b1Q9DBG3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ap2b1Q9DBG3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap2b1Q9DBG3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap2b1Q9DBG3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap2b1Q9DBG3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap2b1Q9DBG3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap2b1Q9DBG3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap2b1Q9DBG3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap2b1Q9DBG3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap2b1Q9DBG3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ap2b1Q9DBG3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap2b1Q9DBG3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap2b1Q9DBG3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap2b1Q9DBG3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap2b1Q9DBG3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ap2b1Q9DBG3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap2b1Q9DBG3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ap2b1Q9DBG3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap2b1Q9DBG3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap2b1Q9DBG3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap2b1Q9DBG3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap2b1Q9DBG3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap2b1Q9DBG3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap2b1Q9DBG3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ap2b1Q9DBG3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap2b1Q9DBG3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap2b1Q9DBG3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap2b1Q9DBG3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ap2b1Q9DBG3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms