Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Gabra5Q8BHJ7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Gabra5Q8BHJ7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Gabra5Q8BHJ7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Gabra5Q8BHJ7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Gabra5Q8BHJ7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gabra5Q8BHJ7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Gabra5Q8BHJ7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Gabra5Q8BHJ7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gabra5Q8BHJ7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Gabra5Q8BHJ7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gabra5Q8BHJ7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Gabra5Q8BHJ7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gabra5Q8BHJ7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gabra5Q8BHJ7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Gabra5Q8BHJ7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gabra5Q8BHJ7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gabra5Q8BHJ7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gabra5Q8BHJ7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gabra5Q8BHJ7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gabra5Q8BHJ7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gabra5Q8BHJ7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gabra5Q8BHJ7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gabra5Q8BHJ7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gabra5Q8BHJ7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gabra5Q8BHJ7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Gabra5Q8BHJ7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Gabra5Q8BHJ7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gabra5Q8BHJ7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gabra5Q8BHJ7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gabra5Q8BHJ7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gabra5Q8BHJ7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gabra5Q8BHJ7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gabra5Q8BHJ7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gabra5Q8BHJ7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gabra5Q8BHJ7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gabra5Q8BHJ7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Gabra5Q8BHJ7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gabra5Q8BHJ7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gabra5Q8BHJ7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Gabra5Q8BHJ7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gabra5Q8BHJ7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gabra5Q8BHJ7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gabra5Q8BHJ7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gabra5Q8BHJ7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gabra5Q8BHJ7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gabra5Q8BHJ7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gabra5Q8BHJ7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gabra5Q8BHJ7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gabra5Q8BHJ7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gabra5Q8BHJ7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gabra5Q8BHJ7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gabra5Q8BHJ7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gabra5Q8BHJ7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gabra5Q8BHJ7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gabra5Q8BHJ7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gabra5Q8BHJ7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gabra5Q8BHJ7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gabra5Q8BHJ7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Gabra5Q8BHJ7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gabra5Q8BHJ7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gabra5Q8BHJ7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gabra5Q8BHJ7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gabra5Q8BHJ7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gabra5Q8BHJ7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gabra5Q8BHJ7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gabra5Q8BHJ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gabra5Q8BHJ7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gabra5Q8BHJ7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gabra5Q8BHJ7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gabra5Q8BHJ7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gabra5Q8BHJ7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gabra5Q8BHJ7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gabra5Q8BHJ7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gabra5Q8BHJ7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gabra5Q8BHJ7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gabra5Q8BHJ7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gabra5Q8BHJ7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gabra5Q8BHJ7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gabra5Q8BHJ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Gabra5Q8BHJ7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gabra5Q8BHJ7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gabra5Q8BHJ7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gabra5Q8BHJ7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gabra5Q8BHJ7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gabra5Q8BHJ7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gabra5Q8BHJ7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gabra5Q8BHJ7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gabra5Q8BHJ7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gabra5Q8BHJ7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gabra5Q8BHJ7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gabra5Q8BHJ7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gabra5Q8BHJ7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gabra5Q8BHJ7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.6 ms