Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
PolgP54099 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PolgP54099 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PolgP54099 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PolgP54099 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PolgP54099 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PolgP54099 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PolgP54099 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PolgP54099 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PolgP54099 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PolgP54099 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PolgP54099 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PolgP54099 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PolgP54099 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PolgP54099 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PolgP54099 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PolgP54099 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PolgP54099 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PolgP54099 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PolgP54099 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PolgP54099 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PolgP54099 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PolgP54099 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PolgP54099 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PolgP54099 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PolgP54099 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PolgP54099 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PolgP54099 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PolgP54099 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PolgP54099 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PolgP54099 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PolgP54099 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PolgP54099 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PolgP54099 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PolgP54099 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PolgP54099 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PolgP54099 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PolgP54099 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PolgP54099 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PolgP54099 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PolgP54099 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PolgP54099 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PolgP54099 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PolgP54099 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PolgP54099 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PolgP54099 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PolgP54099 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PolgP54099 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PolgP54099 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PolgP54099 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PolgP54099 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PolgP54099 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PolgP54099 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PolgP54099 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PolgP54099 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PolgP54099 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PolgP54099 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PolgP54099 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PolgP54099 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PolgP54099 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PolgP54099 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PolgP54099 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PolgP54099 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PolgP54099 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PolgP54099 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PolgP54099 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PolgP54099 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PolgP54099 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PolgP54099 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PolgP54099 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PolgP54099 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PolgP54099 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PolgP54099 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PolgP54099 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PolgP54099 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PolgP54099 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PolgP54099 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PolgP54099 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PolgP54099 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PolgP54099 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PolgP54099 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PolgP54099 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PolgP54099 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PolgP54099 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PolgP54099 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PolgP54099 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PolgP54099 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PolgP54099 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PolgP54099 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PolgP54099 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PolgP54099 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PolgP54099 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PolgP54099 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PolgP54099 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PolgP54099 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PolgP54099 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PolgP54099 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PolgP54099 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PolgP54099 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PolgP54099 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms