Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Cab39lQ9DB16 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cab39lQ9DB16 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cab39lQ9DB16 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cab39lQ9DB16 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cab39lQ9DB16 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cab39lQ9DB16 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Cab39lQ9DB16 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Cab39lQ9DB16 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cab39lQ9DB16 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cab39lQ9DB16 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Cab39lQ9DB16 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cab39lQ9DB16 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Cab39lQ9DB16 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cab39lQ9DB16 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cab39lQ9DB16 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cab39lQ9DB16 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Cab39lQ9DB16 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cab39lQ9DB16 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cab39lQ9DB16 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cab39lQ9DB16 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cab39lQ9DB16 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cab39lQ9DB16 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cab39lQ9DB16 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cab39lQ9DB16 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cab39lQ9DB16 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cab39lQ9DB16 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Cab39lQ9DB16 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cab39lQ9DB16 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cab39lQ9DB16 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cab39lQ9DB16 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Cab39lQ9DB16 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cab39lQ9DB16 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cab39lQ9DB16 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cab39lQ9DB16 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cab39lQ9DB16 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cab39lQ9DB16 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cab39lQ9DB16 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cab39lQ9DB16 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cab39lQ9DB16 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cab39lQ9DB16 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cab39lQ9DB16 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cab39lQ9DB16 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cab39lQ9DB16 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cab39lQ9DB16 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cab39lQ9DB16 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cab39lQ9DB16 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cab39lQ9DB16 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cab39lQ9DB16 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cab39lQ9DB16 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cab39lQ9DB16 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cab39lQ9DB16 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cab39lQ9DB16 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cab39lQ9DB16 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cab39lQ9DB16 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cab39lQ9DB16 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cab39lQ9DB16 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cab39lQ9DB16 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cab39lQ9DB16 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cab39lQ9DB16 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cab39lQ9DB16 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cab39lQ9DB16 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cab39lQ9DB16 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cab39lQ9DB16 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cab39lQ9DB16 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cab39lQ9DB16 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cab39lQ9DB16 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cab39lQ9DB16 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cab39lQ9DB16 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cab39lQ9DB16 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cab39lQ9DB16 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cab39lQ9DB16 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cab39lQ9DB16 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cab39lQ9DB16 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cab39lQ9DB16 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cab39lQ9DB16 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cab39lQ9DB16 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cab39lQ9DB16 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cab39lQ9DB16 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cab39lQ9DB16 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cab39lQ9DB16 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cab39lQ9DB16 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cab39lQ9DB16 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cab39lQ9DB16 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cab39lQ9DB16 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cab39lQ9DB16 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cab39lQ9DB16 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cab39lQ9DB16 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cab39lQ9DB16 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cab39lQ9DB16 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cab39lQ9DB16 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cab39lQ9DB16 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cab39lQ9DB16 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cab39lQ9DB16 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cab39lQ9DB16 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cab39lQ9DB16 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cab39lQ9DB16 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cab39lQ9DB16 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cab39lQ9DB16 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cab39lQ9DB16 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms