Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,43■■■■■ 4,7
Hoxc6P10629 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
Hoxc6P10629 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Hoxc6P10629 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,66■■■■□ 3,78
Hoxc6P10629 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,53■■■■□ 3,76
Hoxc6P10629 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,65■■■■□ 3,62
Hoxc6P10629 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
Hoxc6P10629 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Hoxc6P10629 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Hoxc6P10629 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,08■■■■□ 3,53
Hoxc6P10629 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Hoxc6P10629 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Hoxc6P10629 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,12■■■■□ 3,37
Hoxc6P10629 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Hoxc6P10629 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Hoxc6P10629 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,81■■■■□ 3,32
Hoxc6P10629 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,77■■■■□ 3,32
Hoxc6P10629 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Hoxc6P10629 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Hoxc6P10629 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Hoxc6P10629 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Hoxc6P10629 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Hoxc6P10629 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Hoxc6P10629 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Hoxc6P10629 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,18■■■■□ 3,22
Hoxc6P10629 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Hoxc6P10629 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Hoxc6P10629 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Hoxc6P10629 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Hoxc6P10629 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Hoxc6P10629 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,53■■■■□ 3,12
Hoxc6P10629 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Hoxc6P10629 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Hoxc6P10629 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Hoxc6P10629 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Hoxc6P10629 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Hoxc6P10629 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Hoxc6P10629 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Hoxc6P10629 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Hoxc6P10629 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Hoxc6P10629 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,84■■■■□ 3,01
Hoxc6P10629 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Hoxc6P10629 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
Hoxc6P10629 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Hoxc6P10629 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,71■■■□□ 2,99
Hoxc6P10629 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Hoxc6P10629 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Hoxc6P10629 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Hoxc6P10629 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,42■■■□□ 2,94
Hoxc6P10629 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Hoxc6P10629 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,33■■■□□ 2,93
Hoxc6P10629 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Hoxc6P10629 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Hoxc6P10629 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Hoxc6P10629 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Hoxc6P10629 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Hoxc6P10629 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Hoxc6P10629 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Hoxc6P10629 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Hoxc6P10629 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Hoxc6P10629 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Hoxc6P10629 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Hoxc6P10629 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Hoxc6P10629 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Hoxc6P10629 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32,87■■■□□ 2,85
Hoxc6P10629 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Hoxc6P10629 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Hoxc6P10629 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Hoxc6P10629 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Hoxc6P10629 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,64■■■□□ 2,82
Hoxc6P10629 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Hoxc6P10629 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Hoxc6P10629 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Hoxc6P10629 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Hoxc6P10629 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Hoxc6P10629 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,51■■■□□ 2,8
Hoxc6P10629 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Hoxc6P10629 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Hoxc6P10629 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Hoxc6P10629 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Hoxc6P10629 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Hoxc6P10629 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Hoxc6P10629 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Hoxc6P10629 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,22■■■□□ 2,75
Hoxc6P10629 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,2■■■□□ 2,75
Hoxc6P10629 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Hoxc6P10629 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Hoxc6P10629 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Hoxc6P10629 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Hoxc6P10629 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,07■■■□□ 2,72
Hoxc6P10629 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Hoxc6P10629 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Hoxc6P10629 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2,71
Hoxc6P10629 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Hoxc6P10629 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Hoxc6P10629 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Hoxc6P10629 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Hoxc6P10629 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Hoxc6P10629 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Hoxc6P10629 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,8 ms