RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 MON1BQ7L1V2 547 aa17.44■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 PPIL6Q8IXY8 311 aa17.44■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 EFCAB3Q8N7B9 438 aa17.44■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 PIM2Q9P1W9 311 aa17.44■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 HACL1Q9UJ83 578 aa17.44■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 WDR64B1ANS9 1081 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 DNAJA2O60884 412 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 AOC1P19801 751 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 GK3PQ14409 553 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 KRT81Q14533 505 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 LPIN1Q14693 890 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 PASD1Q8IV76 773 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 MICALL2Q8IY33 904 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 BSNDQ8WZ55 320 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 DCUN1D1Q96GG9 259 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SLX1AQ9BQ83 275 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 PI4K2AQ9BTU6 479 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 CDH22Q9UJ99 828 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 H3BNX3 289 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 VWA5AO00534 786 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 CYB561D2O14569 222 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 PMM2O15305 246 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TLR3O15455 904 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 DENRO43583 198 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 PEX1O43933 1283 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 PROCP04070 461 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 NPTX2P47972 431 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 MAMLD1Q13495 774 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 ATG16L1Q676U5 607 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 CRLF3Q8IUI8 442 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 C4orf19Q8IY42 314 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 C20orf27Q9GZN8 174 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 POMPQ9Y244 141 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TTLL13PA6NNM8 815 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TMEM63AO94886 807 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 DSG3P32926 999 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 ALDH1A3P47895 512 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 GPC3P51654 580 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 GDF10P55107 478 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TNFAIP1Q13829 316 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TEX44Q53QW1 395 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 IYDQ6PHW0 289 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 RCOR2Q8IZ40 523 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SLC35B4Q969S0 331 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 CNBD2Q96M20 576 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 GABBR1Q9UBS5 961 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 WDR37Q9Y2I8 494 aa17.43■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 ITGAVP06756 1048 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 IRX4P78413 519 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 MYBPC1Q00872 1141 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 PGM2L1Q6PCE3 622 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 HPS6Q86YV9 775 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 IGDCC3Q8IVU1 814 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 NAT8LQ8N9F0 302 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 FBXL13Q8NEE6 735 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SLC44A1Q8WWI5 657 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SDR42E2A6NKP2 422 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 H3BSA7 217 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 FAM155BO75949 473 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 CFHP08603 1231 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 COPAP53621 1224 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 HMGCS2P54868 508 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 CNGA3Q16281 694 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 LIN9Q5TKA1 542 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 ZNF410Q86VK4 478 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 C12orf56Q8IXR9 622 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TTC13Q8NBP0 860 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 CEP170P1Q96L14 293 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 INIPQ9NRY2 104 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TBX20Q9UMR3 447 aa17.42■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TRIM49D1C9J1S8 452 aa17.41■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 E7ESA3 106 aa17.41■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 LYPLA2O95372 231 aa17.41■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 TNFAIP8O95379 198 aa17.41■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 NR3C2P08235 984 aa17.41■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 CD48P09326 243 aa17.41■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 MAPTP10636 758 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
GDE1-201ENST00000353258 PHEXP78562 749 aa17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms