RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261489.6

TSC22D1-201, Transcript of TSC22 domain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSC22D1, Length 3,135 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1-201ENST00000261489 MIB1Q86YT6 1006 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 ABHD8Q96I13 439 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PEBP4Q96S96 227 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 DSEQ9UL01 958 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 USP18Q9UMW8 372 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PER2O15055 1255 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 ZBED1O96006 694 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SETSIPP0DME0 302 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 RARAP10276 462 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 GPD1P21695 349 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PBX2P40425 430 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PLA2G4AP47712 749 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 NRLP54845 237 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 ROR1Q01973 937 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 FIBCD1Q8N539 461 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 KCTD6Q8NC69 237 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CD101Q93033 1021 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 RNF34Q969K3 372 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 TMEM59LQ9UK28 342 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 NR2E3Q9Y5X4 410 aa9.3□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 FGF18O76093 207 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 MTM1Q13496 603 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SHHQ15465 462 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 BSPRYQ5W0U4 402 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CEP112Q8N8E3 955 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 IFT81Q8WYA0 676 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PNKPQ96T60 521 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SIK2Q9H0K1 926 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PRPSAP2O60256 369 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CAPN15O75808 1086 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 FYNP06241 537 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CA3P07451 260 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 GABRB2P47870 512 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SULT1E1P49888 294 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CDH6P55285 790 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 HDAC4P56524 1084 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CCDC185Q8N715 623 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 GOLGA1Q92805 767 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 NMUR1Q9HB89 426 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 DDIT4Q9NX09 232 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 MTMR11A4FU01 709 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 HIDE1A8MVS5 230 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 INPPL1O15357 1258 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CREB3O43889 395 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 TYMPP19971 482 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 FGFR3P22607 806 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CTNNB1P35222 781 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 HSFY1Q96LI6 401 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CHST7Q9NS84 486 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 OSER1Q9NX31 292 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SPG21Q9NZD8 308 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 WDR35Q9P2L0 1181 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.29□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 A0A1W2PQH9 124 aa9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 CCDC66A2RUB6 948 aa9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 HHLA1C9JL84 531 aa9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PRRG1O14668 218 aa9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 MTA2O94776 668 aa9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 SEC24AO95486 1093 aa9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 VNN2O95498 520 aa9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 ERVFC1P60507 584 aa9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 TAF12Q16514 161 aa9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TSC22D1-201ENST00000261489 PKMYT1Q99640 499 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms