RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C TAT1P38085 619 aa3.6□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C NCL1P38205 684 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C TPS3P38426 1054 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C LSB6P42951 607 aa3.6□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C NHA1Q99271 985 aa3.6□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C RPC31P17890 251 aa3.59□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C SUV3P32580 737 aa3.59□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C APM2P38700 605 aa3.59□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C MTO1P53070 669 aa3.59□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C PRK1P40494 810 aa3.58□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C ECM23Q02710 187 aa3.58□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C MCA1Q08601 432 aa3.58□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C VAN1P23642 535 aa3.57□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C CPS1P27614 576 aa3.57□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C PGM2P37012 569 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C BUD9P53226 547 aa3.57□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C GIS4Q04233 774 aa3.57□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C CAB1Q04430 367 aa3.57□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C ALG14P38242 237 aa3.56□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C PRY1P47032 299 aa3.56□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C YPL034WQ03083 165 aa3.56□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C TRS33Q99394 268 aa3.56□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C NAR1P23503 491 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C AI3P03877 415 aa3.55□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C CWH41P53008 833 aa3.55□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C YNR040WP53736 256 aa3.55□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C SLP1Q12232 587 aa3.55□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C UBX7P38349 436 aa3.54□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C YER156CP40093 338 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C CWC15Q03772 175 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C PUF6Q04373 656 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C NOB1Q08444 459 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C YBR197CP38306 217 aa3.54□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C QDR2P40474 542 aa3.54□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C MRPL33P20084 86 aa3.53□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C SSA4P22202 642 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C SFA1P32771 386 aa3.53□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C PGM1P33401 570 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
HDA3YPR179C IDI1P15496 288 aa3.52□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C SAC7P17121 654 aa3.52□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data3.52□□□□□ -1.85not detected
HDA3YPR179C ALD4P46367 519 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C ARI1P53111 347 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C ITC1P53125 1264 aa3.52□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C YML083CQ04526 418 aa3.52□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C YOR296WQ08748 1289 aa3.52□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C VMA3P25515 160 aa3.52□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C DYS1P38791 387 aa3.52□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C SRS2P12954 1174 aa3.51□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C RLF2Q12495 606 aa3.51□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C GIP1P38229 639 aa3.51□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C RRM3P38766 723 aa3.51□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C INP52P50942 1183 aa3.51□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C KTR2P33550 425 aa3.5□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C TAF7Q05021 590 aa3.5□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C APC11Q12157 165 aa3.5□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa3.49□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C MRP10O75012 95 aa3.49□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C ISC10P32645 267 aa3.49□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C MAC1P35192 417 aa3.49□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C LDH1P38139 375 aa3.49□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C RSC2Q06488 889 aa3.49□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C SUB2Q07478 446 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C TY4A-HQ6Q5P6 413 aa3.49□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C ISW1P38144 1129 aa3.49□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C PUN1Q06991 263 aa3.49□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C BSD2P38356 321 aa3.48□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C ALO1P54783 526 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C FOX2Q02207 900 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C BOI1P38041 980 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C YIL165CP40446 119 aa3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C DSE4P53753 1117 aa3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C PNP1Q05788 311 aa3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C GAS5Q08193 484 aa3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C LSO1Q3E827 93 aa3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C MSN1P22148 382 aa3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C RSC6P25632 483 aa3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C OMA1P36163 345 aa3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C YBR287WP38355 427 aa3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C GIP2P40036 548 aa3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C LEM3P42838 414 aa3.47□□□□□ -1.85
HDA3YPR179C TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C KAE1P36132 386 aa3.45□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C HXT8P40886 569 aa3.45□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C GUP1P53154 560 aa3.45□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C EMG1Q06287 252 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C MED7Q08278 222 aa3.45□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C COQ2P32378 372 aa3.44□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C SAF1P38352 637 aa3.44□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C BOL3P39724 118 aa3.44□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C INP51P40559 946 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C RGD2P43556 714 aa3.44□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C PPT1P53043 513 aa3.44□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C SOK2P53438 785 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C RRN6P32786 894 aa3.43□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C NTA1P40354 457 aa3.43□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C TED1P40533 473 aa3.43□□□□□ -1.86
HDA3YPR179C BIO5P53744 561 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
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