RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	ATG16	Q03818	150 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	SLX4	Q12098	748 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	CDC11	P32458	415 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	SUV3	P32580	737 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	SLI15	P38283	698 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	SOH1	P38633	127 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
SYF1	YDR416W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	ERP4	Q12450	207 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	NFU1	P32860	256 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	UFD2	P54860	961 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	CDC25	P04821	1589 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	YRR1	Q12172	810 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	YDR416W	ADR1	P07248	1323 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	GUT2	P32191	649 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	PEX21	P50091	288 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	MTC5	Q03897	1148 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	FLC1	Q08967	793 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	SIN3	P22579	1536 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	TEC1	P18412	486 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	SAM37	P50110	327 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	TYW3	P53177	273 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	YPR084W	Q06821	456 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	ATP4	P05626	244 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	IES5	P40060	125 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	CDC73	Q06697	393 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	OPI10	Q08202	246 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	OXR1	Q08952	273 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	APC11	Q12157	165 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	PRI2	P20457	528 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	YAP5	P40574	245 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	YGR053C	P53234	283 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	TBF1	Q02457	562 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	CDC34	P14682	295 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	UBP1	P25037	809 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	DAS1	P47005	663 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	TUB4	P53378	473 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	TOS4	Q06266	489 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	ERR1	P0CX10	437 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	ERR2	P0CX11	437 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	BLI1	P35727	113 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	BDP1	P46678	594 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	CDC55	Q00362	526 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	TMA17	Q12513	150 aa		5	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	MTC2	P34246	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	FIG4	P42837	879 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	CWH41	P53008	833 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
SYF1	YDR416W	YBR197C	P38306	217 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	VID27	P40157	782 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	YNL011C	P53980	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	YKL069W	P36088	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	DCW1	P36091	449 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	NYV1	Q12255	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	PIF1	P07271	859 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	RPB10	P22139	70 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	HIR1	P32479	840 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	FAA3	P39002	694 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	HOS4	P40480	1083 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	SND1	Q04007	877 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	NTG2	Q08214	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	BDS1	Q08347	646 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	CIT1	P00890	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	MSH2	P25847	964 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	SFP1	P32432	683 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	YHL008C	P38750	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	YJR120W	P47157	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	ISC10	P32645	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	DUT1	P33317	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	NIT1	P40447	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	DAN4	P47179	1161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	YGR237C	P50089	785 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	RKR1	Q04781	1562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	YDR416W	KEX2	P13134	814 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	ATG13	Q06628	738 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	CCP1	P00431	361 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	CAN1	P04817	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	MAL31	P38156	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	YDR416W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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