RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626515.2

PCBP1-AS1-294, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 1,041 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 NDUFV2P19404 249 aa10.34□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 GCGRP47871 477 aa10.33□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.33□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.33□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 KIAA1468Q9P260 1216 aa10.33□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.33□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.33□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SYNJ1O43426 1573 aa10.32□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SMAPO00193 183 aa10.32□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 ABL2P42684 1182 aa10.32□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 MTMR14Q8NCE2 650 aa10.32□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.32□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 FDX1P10109 184 aa10.31□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 QPCTQ16769 361 aa10.31□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PROX2Q3B8N5 592 aa10.31□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.31□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 KIF13AQ9H1H9 1805 aa10.29□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 C3orf80F5H4A9 247 aa10.29□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 POTEB2H3BUK9 544 aa10.29□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 HOXA2O43364 376 aa10.29□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.29□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 USP17L8P0C7I0 530 aa10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 WDR97A6NE52 1622 aa10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 HRCP23327 699 aa10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SLF2Q8IX21 1173 aa10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PDE4CQ08493 712 aa10.26□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 ARHGAP33O14559 1287 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 MTMR2Q13614 643 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 WASHC4Q2M389 1173 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 NECTIN2Q92692 538 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 TSC1Q92574 1164 aa10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 ERBB3P21860 1342 aa10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 C6orf229H3BNL8 230 aa10.21□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SLC10A3P09131 477 aa10.21□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PBX2P40425 430 aa10.21□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 GLMNQ92990 594 aa10.21□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.21□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PSEN2P49810 448 aa10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 LAPTM4BQ86VI4 370 aa10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 NBPF3Q9H094 633 aa10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 KMT5BQ4FZB7 885 aa10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PCDHGC3Q9UN70 934 aa10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PBRM1Q86U86 1689 aa10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SYNJ2O15056 1496 aa10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 ATP6V1AP38606 617 aa10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PNMA1Q8ND90 353 aa10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.17□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 RNF40O75150 1001 aa10.17□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 CFHP08603 1231 aa10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 FUT2Q10981 343 aa10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 POM121CA8CG34 1229 aa10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 GUCA2AQ02747 115 aa10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SAMD7Q7Z3H4 446 aa10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SOGA1O94964 1423 aa10.15□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 Q3C1V9 767 aa10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PRR14Q9BWN1 585 aa10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 GRIN2BQ13224 1484 aa10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 SOX11P35716 441 aa10.13□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 HLA-CQ95604 372 aa10.12□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 CFAP99D6REC4 459 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 IRF5Q13568 498 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 RETREG2Q8NC44 543 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 PRR7Q8TB68 274 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 RETREG3Q86VR2 466 aa10.1□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.1□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-294ENST00000626515 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms