RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 INCA1Q0VD86 236 aa29.6■■■□□ 2.33
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TRIOBP-209ENST00000428075 ERMP1Q7Z2K6 904 aa29.6■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 KIAA1958Q8N8K9 716 aa29.6■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 EEF2KMTQ96G04 330 aa29.6■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM49BQ9NUQ9 324 aa29.6■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 CFAP97Q9P2B7 532 aa29.6■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 ATG13O75143 517 aa29.59■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 NFATC1O95644 943 aa29.59■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 CYP17A1P05093 508 aa29.59■■■□□ 2.33
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TRIOBP-209ENST00000428075 PDZD8Q8NEN9 1154 aa29.59■■■□□ 2.33
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TRIOBP-209ENST00000428075 GMEB2Q9UKD1 530 aa29.59■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 RAB23Q9ULC3 237 aa29.59■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa29.59■■■□□ 2.33
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TRIOBP-209ENST00000428075 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 SDK1Q7Z5N4 2213 aa29.58■■■□□ 2.33
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TRIOBP-209ENST00000428075 ENGASEQ8NFI3 743 aa29.58■■■□□ 2.33
TRIOBP-209ENST00000428075 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa29.58■■■□□ 2.33
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TRIOBP-209ENST00000428075 RETP07949 1114 aa29.57■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 MAP3K7CLP57077 242 aa29.57■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 SPEM2Q0P670 501 aa29.57■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 DHCR24Q15392 516 aa29.57■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 EDRF1Q3B7T1 1238 aa29.57■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 RHBDF2Q6PJF5 856 aa29.57■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa29.57■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 WBP2Q969T9 261 aa29.57■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 MMRN2Q9H8L6 949 aa29.57■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 COMMD8Q9NX08 183 aa29.57■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC8A2Q9UPR5 921 aa29.57■■■□□ 2.32
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TRIOBP-209ENST00000428075 K7EQS6 105 aa29.56■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
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TRIOBP-209ENST00000428075 FOXK2Q01167 660 aa29.56■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 HECTD3Q5T447 861 aa29.56■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 SFTPA1Q8IWL2 248 aa29.56■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 HHIPQ96QV1 700 aa29.56■■■□□ 2.32
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TRIOBP-209ENST00000428075 EML5Q05BV3 1969 aa29.55■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa29.55■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 ADORA2BP29275 332 aa29.55■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 PRCPP42785 496 aa29.55■■■□□ 2.32
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC6A11P48066 632 aa29.55■■■□□ 2.32
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TRIOBP-209ENST00000428075 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
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TRIOBP-209ENST00000428075 USP18Q9UMW8 372 aa29.55■■■□□ 2.32
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TRIOBP-209ENST00000428075 C12orf40Q86WS4 652 aa29.54■■■□□ 2.32
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TRIOBP-209ENST00000428075 GAB3Q8WWW8 586 aa29.54■■■□□ 2.32
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TRIOBP-209ENST00000428075 COBLL1Q53SF7 1204 aa29.51■■■□□ 2.31
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