RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 OLFML1Q6UWY5 402 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 TMC3Q7Z5M5 1100 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 ATL2Q8NHH9 583 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 SLC2A14Q8TDB8 520 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP18.8■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 CCDC114Q96M63 670 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 SH3GL2Q99962 352 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 HOMER3Q9NSC5 361 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 ASNSD1Q9NWL6 643 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 RNF8O76064 485 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
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ACTB-201ENST00000331789 TKTP29401 623 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 PTPN7P35236 360 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 APLP1P51693 650 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 CDR1P51861 262 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 BST2Q10589 180 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 TFDP3Q5H9I0 405 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 FAM26DQ5JW98 314 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 PXYLP1Q8TE99 480 aa18.79■□□□□ 0.6
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ACTB-201ENST00000331789 RUFY1Q96T51 708 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 ADAM2Q99965 735 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 PLAAQ9Y263 795 aa18.79■□□□□ 0.6
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ACTB-201ENST00000331789 TJP3O95049 919 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 INHAP05111 366 aa18.78■□□□□ 0.6
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ACTB-201ENST00000331789 ACAP1Q15027 740 aa18.78■□□□□ 0.6
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ACTB-201ENST00000331789 C3orf58Q8NDZ4 430 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 CLEC4CQ8WTT0 213 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 PEBP4Q96S96 227 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 CNPY3Q9BT09 278 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 OPA1O60313 960 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 ZNF623O75123 536 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 PPFIA2O75334 1257 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 CD48P09326 243 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 LCP1P13796 627 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 VEGFBP49765 207 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 BCAT1P54687 386 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 PTK6Q13882 451 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 LHX8Q68G74 356 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 GRK7Q8WTQ7 553 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 HSPH1Q92598 858 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 ART4Q93070 314 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 ARL8AQ96BM9 186 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 TNIP3Q96KP6 325 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 CFAP57Q96MR6 1250 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 PAAF1Q9BRP4 392 aa18.78■□□□□ 0.6
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ACTB-201ENST00000331789 LIASO43766 372 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 POMCP01189 267 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 CDO1Q16878 200 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 PRUNE1Q86TP1 453 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 HAUS1Q96CS2 278 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 GLT1D1Q96MS3 346 aa18.77■□□□□ 0.6
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ACTB-201ENST00000331789 ADAM21Q9UKJ8 722 aa18.77■□□□□ 0.6
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ACTB-201ENST00000331789 NEU2Q9Y3R4 380 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-201ENST00000331789 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
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ACTB-201ENST00000331789 KRT14P02533 472 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 GBP1P32455 592 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 PCK1P35558 622 aa18.76■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 ATP11AP98196 1134 aa18.76■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa18.76■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 RSAD1Q9HA92 442 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 FRMPD3Q5JV73 1810 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 MOXD2PA6NHM9 499 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 H0YGN5 161 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 GAS8O95995 478 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 FAM163BP0C2L3 166 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 CKBP12277 381 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 IVDP26440 423 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 MAP2K2P36507 400 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 RPL34P49207 117 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ACTB-201ENST00000331789 SNX16P57768 344 aa18.76■□□□□ 0.59
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