RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	WASF3	Q9UPY6	502 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DMD	P11532	3685 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DCLK1	O15075	740 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HUS1	O60921	280 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NFATC1	O95644	943 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	AFM	P43652	599 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	LHX1	P48742	406 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ACOT2	P49753	483 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MYL7	Q01449	175 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ZNF77	Q15935	545 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	EML3	Q32P44	896 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	RESP18	Q5W5W9	173 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ADAL	Q6DHV7	355 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	USP33	Q8TEY7	942 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HVCN1	Q96D96	273 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	EHD2	Q9NZN4	543 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MYMK	A6NI61	221 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688		H0Y626	953 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TNFRSF10B	O14763	440 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GIPC1	O14908	333 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TRIM16	O95361	564 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CKM	P06732	381 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HDC	P19113	662 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PCSK1	P29120	753 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HOXD12	P35452	270 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PPP3CC	P48454	512 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NDUFA8	P51970	172 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	IRX4	P78413	519 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	USP4	Q13107	963 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	KCNB1	Q14721	858 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CRY1	Q16526	586 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DPH6	Q7L8W6	267 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SYT12	Q8IV01	421 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GATA6	Q92908	595 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HPS3	Q969F9	1004 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GCNT4	Q9P109	453 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688		A0A0A0MRY4	1105 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688		K7EQS6	105 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GABRD	O14764	452 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MAP3K13	O43283	966 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TADA3	O75528	432 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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