RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP3CBP16298 524 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 TNFSF4P23510 183 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 LOXL3P58215 753 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 TUBB3Q13509 450 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 BRD3Q15059 726 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 PLA1AQ53H76 456 aa3.97□□□□□ -1.77
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RABGGTB-211ENST00000489450 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 UNC13DQ70J99 1090 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF152Q8N8N0 203 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC30A5Q8TAD4 765 aa3.97□□□□□ -1.77
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RABGGTB-211ENST00000489450 SNX22Q96L94 193 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC138Q96M89 665 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 BRIP1Q9BX63 1249 aa3.97□□□□□ -1.77
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RABGGTB-211ENST00000489450 CHST8Q9H2A9 424 aa3.97□□□□□ -1.77
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RABGGTB-211ENST00000489450 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 HDAC9Q9UKV0 1011 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.97□□□□□ -1.77
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RABGGTB-211ENST00000489450 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 SAMD9Q5K651 1589 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa3.96□□□□□ -1.77
RABGGTB-211ENST00000489450 KIF27Q86VH2 1401 aa3.96□□□□□ -1.77
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF202O95125 648 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 MT-ND5P03915 603 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 TXNP10599 105 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
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RABGGTB-211ENST00000489450 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.96□□□□□ -1.78
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RABGGTB-211ENST00000489450 MORC1Q86VD1 984 aa3.96□□□□□ -1.78
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RABGGTB-211ENST00000489450 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRC4Q9NPP4 1024 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 STARD7Q9NQZ5 370 aa3.96□□□□□ -1.78
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RABGGTB-211ENST00000489450 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 PIPSLA2A3N6 862 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 H7C4K7 107 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-211ENST00000489450 PTPAQ15257 358 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-211ENST00000489450 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-211ENST00000489450 ATP11CQ8NB49 1132 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 BPIFB1Q8TDL5 484 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA1191Q96A73 305 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM136AQ96C01 138 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-211ENST00000489450 IQCDQ96DY2 449 aa3.95□□□□□ -1.78
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