RNA–Protein interactions for RNA: YHR014W

SPO13, Transcript of Meiotic regulator, yeast

Gene SPO13, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO13	YHR014W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	APA2	P22108	325 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	TIM13	P53299	105 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	SED1	Q01589	338 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	CLG1	P35190	452 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	TRS20	P38334	175 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YER121W	P40076	114 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	TIM8	P57744	87 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	AVO2	Q04749	426 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	OCA6	Q12454	224 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	AHC2	P25649	128 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YKR041W	P36134	250 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	FIP1	P45976	327 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	CGR1	P53188	120 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	SHH4	Q06236	168 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	RAF1	Q06891	181 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	HSP30	P25619	332 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	CAF4	P36130	643 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YJR015W	P47090	510 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPO13	YHR014W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	RAD51	P25454	400 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	YEL028W	P39989	153 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	RFC2	P40348	353 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	FMP32	P43557	207 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	SOL1	P50278	321 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	GPI17	Q04080	534 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	SWC7	Q06707	132 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	HSP150	P32478	413 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	SRL3	P36167	246 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	YGL230C	P53074	147 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	HHT1	P61830	136 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	VPS28	Q02767	242 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	SNO1	Q03144	224 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	ROX3	P25046	220 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	YFR035C	P43608	114 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	SIP18	P50263	79 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	YKR005C	Q02203	525 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	YDC1	Q02896	317 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	KEI1	Q06346	221 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	LDB18	Q07887	179 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	YOR214C	Q12282	236 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	SHG1	P38337	142 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	NVJ1	P38881	321 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	TTI2	P47168	421 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	CCC1	P47818	322 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	HOP2	P53187	214 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	YNR064C	P53750	290 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	GRX5	Q02784	150 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	TMA23	Q03525	211 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	YPR127W	Q06494	345 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	GTT2	Q12390	233 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	RPL39	P04650	51 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.42	□□□□□ -2.34	not detected
SPO13	YHR014W	YCR001W	P25347	104 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	VPS51	P36116	164 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	FES1	P38260	290 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	ANB1	P19211	157 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	POG1	P40473	351 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	PAC10	P48363	199 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	FCY1	Q12178	158 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPO13	YHR014W	YCR099C	P25657	155 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	AIM18	P38884	321 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	APS3	P47064	194 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	GEP7	P53171	287 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	GRX3	Q03835	250 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	FIT3	Q08907	204 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	YDR010C	Q12426	110 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	HHY1	P39982	102 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	YGR269W	P40326	108 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	APQ12	P40532	138 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	HOR7	Q05827	59 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	NKP2	Q06162	153 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	GRE1	Q08969	168 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	YDL157C	Q12082	118 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPO13	YHR014W	MHF1	Q3E835	90 aa		0.39	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 130.4 ms