RNA–Protein interactions for RNA: YHL027W

RIM101, Transcript of Cys2His2 zinc-finger transcriptional repressor, yeast

Gene RIM101, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM101	YHL027W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	JID1	Q12350	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	MCH2	P36032	473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	PAU7	P39545	55 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YLR460C	P54007	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	MRX11	Q03079	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	RAV2	Q03956	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	TOA2	P32774	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	SBH2	P52871	88 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	SDH7	Q04401	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	KRE1	P17260	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YMR31	P19955	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	SFT2	P38166	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YPL073C	P40323	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	DIC1	Q06143	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	FZF1	P32805	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	CSH1	P38287	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
RIM101	YHL027W	YER181C	P40097	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	UBC13	P52490	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	IRC25	Q07951	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	MRS3	P10566	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	HSP150	P32478	413 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YBR144C	P34215	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	MOH1	P38191	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YFR045W	P43617	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YDL186W	P48568	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YGR045C	P53229	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	HPA2	Q06592	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	HNT3	Q08702	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	RFM1	Q12192	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	ROX3	P25046	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	FIT2	Q08906	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RIM101	YHL027W	MXR2	P25566	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YCH1	P42937	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	TRS23	Q03784	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YHP1	Q04116	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	HPF1	Q05164	967 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	MSA1	Q08471	629 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	IMP1	P28627	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	RPS27B	P38711	82 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YIL029C	P40538	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	TOM7	P53507	60 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	NUP53	Q03790	475 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	UPS1	Q05776	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	RAF1	Q06891	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	EGT2	P42835	1041 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YFR057W	P43625	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	API2	Q04413	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	RAD6	P06104	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	FPR2	P32472	135 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	MRPS5	P33759	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	PCP1	P53259	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	IES6	P32617	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	PET8	P38921	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	OXA1	P39952	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	HUA1	P40325	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	LST8	P41318	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	MRP10	O75012	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	SUN4	P53616	420 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RIM101	YHL027W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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