RNA–Protein interactions for RNA: YGR038W

ORM1, Transcript of Protein that mediates sphingolipid homeostasis, yeast

Gene ORM1, Length 669 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ORM1	YGR038W	RUB1	Q03919	77 aa		3.46	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	NAT5	Q08689	176 aa		3.46	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	RPB11	P38902	120 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	KOG1	P38873	1557 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	KTI11	Q3E840	82 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	COA3	Q3E7B2	85 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	BRP1	P53194	125 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	DCV1	P43595	202 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	YGL230C	P53074	147 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ORM1	YGR038W	KIN28	P06242	306 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	SPP41	P38904	1435 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YFL065C	P43539	102 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	PAU21	P0CE86	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	PAU22	P0CE87	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	FUN14	P18411	198 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	ANB1	P19211	157 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YLR042C	Q07990	161 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YBR242W	P38331	238 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	HSP10	P38910	106 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	ERV14	P53173	138 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	IGO1	P53897	168 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YPL067C	Q02754	198 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	VAM10	Q08474	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YGL149W	P53116	101 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	GTT2	Q12390	233 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	NMT1	P14743	455 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	SEC59	P20048	519 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YKL044W	P36092	106 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	FIT1	Q04433	528 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	SRL3	P36167	246 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YFL051C	P43552	160 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ORM1	YGR038W	YCR099C	P25657	155 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	YBR027C	P38220	110 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	MHF1	Q3E835	90 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	HAP3	P13434	144 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	YAR029W	P39549	74 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	YFR035C	P43608	114 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	SED1	Q01589	338 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	SNT2	P53127	1403 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	MRPL15	P36523	253 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	RTR2	Q12378	196 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	SNF11	P38956	169 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	PAM16	P42949	149 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	TRM732	Q03496	1420 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	RTC6	O14464	93 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	GPI19	Q04082	140 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ORM1	YGR038W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		3.27	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.27	□□□□□ -1.89	not detected
ORM1	YGR038W	YLR296W	Q05898	108 aa		3.27	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	SWR1	Q05471	1514 aa		3.26	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.26	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	TDA2	P40045	126 aa		3.26	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	YPR203W	Q08994	102 aa		3.26	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	TSC11	P40061	1430 aa		3.24	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	AQY2	P0CD90	149 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	YHL037C	P38733	133 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	LST8	P41318	303 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	AIM18	P38884	321 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	YMR122C	Q03879	124 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	FYV7	Q12247	151 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	RIF1	P29539	1916 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ORM1	YGR038W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	PFY1	P07274	126 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	YGR164W	P53291	111 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	SEN15	Q04675	128 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	OCA6	Q12454	224 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	YPL261C	Q08976	102 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	VAR1	P02381	398 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	UBR2	Q07963	1872 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	YHR130C	P38834	111 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	YER187W	P40102	141 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	PRM3	Q08931	133 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ORM1	YGR038W	OST5	Q92316	86 aa		3.16	□□□□□ -1.9

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