RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CLDN5	O00501	218 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	TGM5	O43548	720 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SEC24A	O95486	1093 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	VDR	P11473	427 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CPB1	P15086	417 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CD19	P15391	556 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CLCN4	P51793	760 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ARID5A	Q03989	594 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ASIC2	Q16515	512 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	DUSP6	Q16828	381 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM139	Q8IV31	216 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CNGA4	Q8IV77	575 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ABCB6	Q9NP58	842 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	MICAL2	O94851	1124 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	GLP2R	O95838	553 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ADH1A	P07327	375 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	FER	P16591	822 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PDE6C	P51160	858 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ARPP19	P56211	112 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	FMO1	Q01740	532 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PTK2	Q05397	1052 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	TPGS2	Q68CL5	300 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	TULP2	O00295	520 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PER2	O15055	1255 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	THAP12	O43422	761 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	GABBR2	O75899	941 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SOAT2	O75908	522 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	BEST1	O76090	585 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	C1R	P00736	705 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	MME	P08473	750 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SKIL	P12757	684 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ATF2	P15336	505 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	EPCAM	P16422	314 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ATF6	P18850	670 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CYP2F1	P24903	491 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ADORA2B	P29275	332 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CA8	P35219	290 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	MAGEA11	P43364	429 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CDR2	Q01850	454 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	HYAL1	Q12794	435 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PANX2	Q96RD6	677 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	SMO	Q99835	787 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DNMT1-208	ENST00000586667	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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