RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	APPL2	Q8NEU8	664 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ERMN	Q8TAM6	284 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	BSND	Q8WZ55	320 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF25	Q93038	417 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PNMA5	Q96PV4	448 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TCHP	Q9BT92	498 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP72	Q9P209	647 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CHD6	Q8TD26	2715 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ARID2	Q68CP9	1835 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511		K7ERI5	159 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP11B2	P19099	503 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHB3	P54753	998 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PLD1	Q13393	1074 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PON2	Q15165	354 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	STPG1	Q5TH74	334 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP120	Q8N960	986 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	YIPF1	Q9Y548	306 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC169	A6NNP5	214 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MOSPD3	O75425	235 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MED24	O75448	989 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	EDN1	P05305	212 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PROS1	P07225	676 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF806	P0C7X5	589 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SHC2	P98077	582 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM29	Q14134	588 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CHSY3	Q70JA7	882 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TREML1	Q86YW5	311 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	GAB3	Q8WWW8	586 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	BHMT	Q93088	406 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	LOXL4	Q96JB6	756 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ACAP3	Q96P50	834 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	GSX2	Q9BZM3	304 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	POLD4	Q9HCU8	107 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MAFF	Q9ULX9	164 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	NOTCH4	Q99466	2003 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	VWA8	A3KMH1	1905 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ARNTL	O00327	626 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	EPN2	O95208	641 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK5	O95279	499 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MCM7	P33993	719 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH1A3	P47895	512 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHA5	P54756	1037 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPA	Q15257	358 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	USP37	Q86T82	979 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	KBTBD6	Q86V97	674 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	KIFAP3	Q92845	792 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CDT1	Q9H211	546 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	NCAN	O14594	1321 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ATRX	P46100	2492 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	EXTL3	O43909	919 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG13	O75143	517 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXA6	P31267	233 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MPL	P40238	635 aa		11.79	□□□□□ -0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms