RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ndfip2Q91ZP6 311 aa7.35□□□□□ -1.23
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Capn9Q9D805 690 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Uchl3Q9JKB1 230 aa7.35□□□□□ -1.23
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa7.34□□□□□ -1.23
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp839E9PUU5 921 aa7.34□□□□□ -1.23
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Mrfap1Q9CQL7 125 aa7.34□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cnbd2Q9D5U8 673 aa7.34□□□□□ -1.23
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Dock2Q8C3J5 1828 aa7.34□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm10134F6ZQC6 126 aa7.34□□□□□ -1.23
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q8BGN9 141 aa7.34□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nipal1Q8BMW7 416 aa7.34□□□□□ -1.23
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Rtp1Q8C8C1 263 aa7.34□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q8CEZ4 452 aa7.34□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 LgsnQ8CIX8 563 aa7.34□□□□□ -1.23
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Bmp15Q9Z0L4 392 aa7.34□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cog1Q9Z160 980 aa7.34□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa7.34□□□□□ -1.23
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Krt35Q497I4 455 aa7.34□□□□□ -1.24
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Ttc7aQ8BGB2 858 aa7.34□□□□□ -1.24
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem145Q8C4U2 746 aa7.34□□□□□ -1.24
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rfx6Q8C7R7 927 aa7.34□□□□□ -1.24
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Psmd8Q9CX56 353 aa7.34□□□□□ -1.24
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