Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,04■■■■■ 4
Lrrn2Q6PHP6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Lrrn2Q6PHP6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Lrrn2Q6PHP6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
Lrrn2Q6PHP6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,18■■■■□ 3,38
Lrrn2Q6PHP6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Lrrn2Q6PHP6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,16■■■■□ 3,22
Lrrn2Q6PHP6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,06■■■■□ 3,2
Lrrn2Q6PHP6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Lrrn2Q6PHP6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Lrrn2Q6PHP6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Lrrn2Q6PHP6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Lrrn2Q6PHP6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Lrrn2Q6PHP6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Lrrn2Q6PHP6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Lrrn2Q6PHP6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Lrrn2Q6PHP6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Lrrn2Q6PHP6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Lrrn2Q6PHP6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Lrrn2Q6PHP6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Lrrn2Q6PHP6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,49■■■□□ 2,95
Lrrn2Q6PHP6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
Lrrn2Q6PHP6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,31■■■□□ 2,92
Lrrn2Q6PHP6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Lrrn2Q6PHP6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
Lrrn2Q6PHP6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Lrrn2Q6PHP6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Lrrn2Q6PHP6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Lrrn2Q6PHP6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Lrrn2Q6PHP6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Lrrn2Q6PHP6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Lrrn2Q6PHP6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Lrrn2Q6PHP6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Lrrn2Q6PHP6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Lrrn2Q6PHP6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Lrrn2Q6PHP6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Lrrn2Q6PHP6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Lrrn2Q6PHP6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,32■■■□□ 2,76
Lrrn2Q6PHP6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Lrrn2Q6PHP6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Lrrn2Q6PHP6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,74
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Lrrn2Q6PHP6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Lrrn2Q6PHP6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,08■■■□□ 2,73
Lrrn2Q6PHP6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Lrrn2Q6PHP6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Lrrn2Q6PHP6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Lrrn2Q6PHP6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Lrrn2Q6PHP6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,83■■■□□ 2,69
Lrrn2Q6PHP6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Lrrn2Q6PHP6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Lrrn2Q6PHP6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,76■■■□□ 2,67
Lrrn2Q6PHP6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Lrrn2Q6PHP6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Lrrn2Q6PHP6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Lrrn2Q6PHP6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Lrrn2Q6PHP6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Lrrn2Q6PHP6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Lrrn2Q6PHP6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Lrrn2Q6PHP6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Lrrn2Q6PHP6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Lrrn2Q6PHP6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Lrrn2Q6PHP6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Lrrn2Q6PHP6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Lrrn2Q6PHP6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Lrrn2Q6PHP6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Lrrn2Q6PHP6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Lrrn2Q6PHP6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Lrrn2Q6PHP6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Lrrn2Q6PHP6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Lrrn2Q6PHP6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Lrrn2Q6PHP6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Lrrn2Q6PHP6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Lrrn2Q6PHP6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Lrrn2Q6PHP6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Lrrn2Q6PHP6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Lrrn2Q6PHP6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Lrrn2Q6PHP6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Lrrn2Q6PHP6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Lrrn2Q6PHP6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Lrrn2Q6PHP6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Lrrn2Q6PHP6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Lrrn2Q6PHP6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Lrrn2Q6PHP6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Lrrn2Q6PHP6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Lrrn2Q6PHP6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Lrrn2Q6PHP6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Lrrn2Q6PHP6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Lrrn2Q6PHP6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Lrrn2Q6PHP6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Lrrn2Q6PHP6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Lrrn2Q6PHP6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,29■■■□□ 2,44
Lrrn2Q6PHP6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Lrrn2Q6PHP6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Lrrn2Q6PHP6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Lrrn2Q6PHP6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Lrrn2Q6PHP6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Lrrn2Q6PHP6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
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